Национальный музей Республики Башкортостан основан 23 апреля 1864 года при Губернском Статистическом комитете Оренбургской губернии по инициативе нескольких членов комитета (Н. А. Гурвич, К. А. Бух, А. А. Пеккер, В. И. Власов) при активном участии губернатора Г.С. Аксакова. Являясь одним из старейших в регионе, многократно переименовывался и менял адреса.
С декабря 1989 года музей располагается в здании, которое является памятником архитектуры. Это комплекс стилистически равноценных объектов (арх. А.В. Друкер, Г.В. Топуз и В.Л. Фельдштейн), построенных перед Первой мировой войной и в период Отечественной войны 1941-1945 годов.
В 2001—2003 годах в здании проводился капитальный ремонт. В 35 экспозиционных залах представлены археологические культуры эпохи камня и бронзы; история края в XV-XXI столетиях; этнография и духовная культура наиболее многочисленных народов республики: башкир, русских, татар, мордвы, мари, удмуртов, чувашей, украинцев, и др. Залы, посвящённые природе Башкирии, и