«Душа фирмы» Карла Фаберже всегда была в Санкт-Петербурге, на Большой Морской улице, 24. Там находились основное ювелирное производство, главный магазин, контора, студия дизайнеров, специализированная библиотека, фешенебельная квартира самого Карла Фаберже и ювелирные мастерские, деятельность которых мэтр мог лично контролировать.
Автором проекта здания 1900 года был архитектор Карл Шмидт, сын двоюродной сестры Карла Фаберже, выпускник Императорской академии художеств. Фасад в стиле неоготики облицован серо-розовым гранитом и красным гранитом из Карелии, по свидетельству Олега Агафоновича Фаберже, в истории строительства Петербурга был использован впервые.
В доме был установлен лифт-сейф берлинской фирмы «С.Я. Арнхейм», в котором товар из мастерских доставляли в торговые залы, располагавшиеся на первом этаже.
Многие представители петербургской элиты хранили свои драгоценности у Фаберже. Среди них, например, была прима Мариинского театра Матильда Кшесинская. Она вспоминала, что дома держала лишь мелкие предметы, а крупные, ценные бриллиантовые вещи, большей частью исполненные фирмой Фаберже, - в сейфе дома на Большой Морской.
По совету друга Кшесинской, сына знаменитого ювелира Агафона Карловича, она не брала украшения в зарубежные турне: фирма их страховала и сама передавала за границу. Так, к приезду балерины в Лондон они уже были доставлены в английскую столицу и находились в магазине филиала фирмы Фаберже. Кшесинская называла по телефону только номер вещи (в целях конспирации), и агент-детектив от Фаберже привозил нужную драгоценность в отель или в театр, оставаясь при этом весь вечер поблизости.
В петербургском доме Фаберже, фасад которого до сих пор украшает название фирмы, располагались дизайнерская студия, библиотека по искусству и основные ювелирные мастерские, чью деятельность мэтр мог лично контролировать. Квартира Карла Фаберже находилась на четвертом этаже этого огромного здания - подлинного ювелирного ковчега, где было все необходимое для практически автономного существования мощного предприятия.
В подвальном этаже была устроена кухня и зал-столовая для работников. На первом находились торговые залы, контора, бронированная комната и сейф. На втором, третьем и четвертом этажах дома, а также на всех этажах дворового флигеля работали мастерские. В мансардном этаже располагались артельщики и дворник, там же были прачечная и ателье, видимо, - художественная студия. Интендант занимал помещение на третьем этаже.
В одном из дворовых флигелей размещался еще и гараж. Большой закрытый двор позволял держать в нем каменные глыбы, например, два валуна великолепного нефрита, которые после революции были отправлены в трест «Русские самоцветы».
Помимо Санкт-Петербурга, фирма имела филиалы в Москве (с 1887 года), Одессе (с 1900 года), Киеве (в 1905-1910 годах) и Лондоне (с 1903 года).