В древние времена греки именовали остров Левкос (Белый). У острова существовали и иные наименования — Ахилла, Блаженных, Филоский, Илан-Ада, Шерпилор. А современное название появилось лишь в XIX-XX вв.- из-за того, что дунайское течение регулярно выбрасывало на сушу речных ужей. Была у него и мифологическая версия происхождения - он был подарком со дна морского от богини Фетиды для своего любимого сына Ахилла. В данной форме о нем упоминали в разные периоды классики древних наук — Страбон, Геродот и Овидий. Остров считался одним из обязательных мест остановок на пути из Эллады в Северопричерноморские колонии. Он был ценен своим положением "перевального пункта". Здесь отдыхали, укрывались от штормов, совершали богослужения в святилище Ахилла. Руины возведенного в честь героя храма сохранились до начала XIX в., когда основной функцией острова стало быть маяком и местом службы пограничников. В 2012 году на дне Черного моря возле острова Змеиный была найдена античная галера, затонувшая око