Восточно-славянская Республика, 2011 год.
Некогда процветающая страна решила покинуть список членов Советского Союза и стать самостоятельным игроком на мировой арене. Однако власти страны были не совсем готовы к грядущим последствиям, ведь в государстве так и не была решена проблема классового неравенства. На этом фоне рядовые граждане перешли от слов к делу, подняв бунт и дав старт гражданской войне.
В какой-то момент в противостоянии, помимо обычного оружия, стало использоваться оружие биохимическое. Другими словами, в ВСР стали появляться кровожадные мутанты, которые еще вчера были простыми людьми. Было понятно, что во всем этом как-то замешано наследие "Амбреллы", а потому расследованием событий должен был заняться лучший агент.
Им стал Леон Кеннеди, который прибыл в ВСР с намерением остановить кровопролитие и выяснить, кто стоит за биоатаками на рядовых граждан страны. Оперативник состоял в отряде специального назначения, но после прибытия на место его коллег достаточно быстро уничтожают появившиеся из ниоткуда монстры.
Чтобы выжить Леону пришлось отыскать штаб местного сопротивления и объединиться с повстанцами, воюющими против правящего режима. Вскоре к нему присоединяется агент ЦРУ под позывным Страшила, который также работает внутри страны над устранением угрозы биотерроризма. По всей видимости, именно правительство во главе с президентом Светланой Беликовой решило использовать вирус для того, чтобы подавать очаги сопротивления самым радикальным способом.
Со временем руководство связывается с Леоном и приказывает ему выбираться из страны, так как Штаты анонсируют полноценное вторжение в республику. Однако Кеннеди отказывается следовать приказу - он итак испортил себе отпуск, так что дело нужно довести до конца.
В это время во дворце, где расположен офис госпожи Беликовой, проходит совещание, на котором решается будущее страны. Президент выражает недовольство из-за того, что восстание не удается задавить так быстро, как хотелось бы, ведь из-за внутреннего конфликта ВСР не может стать постоянным членом ООН. Некая дама в красном платье советует первой леди страны поаккуратнее решать свои проблемы с помощью биооружия, так как оно является весьма непредсказуемым и опасным.
Дамой оказывается Ада Вонг - на этот раз шпионка выдает себя за представителя ООН. На самом же деле Ада прибыла сюда с другой целью - добыть образец нового вируса, который понадобится ей для решения неких личных вопросов.
Девушку привлек новый вид заразы модели Лас-Плагас, который позволяет зараженным управлять другими монстрами. Такие есть и у правительства, и у повстанцев - последние были готовы жертвовать собой ради борьбы с режимом. Рядом с мутировавшими бойцами как раз и находился Леон, который стал свидетелем того, на что местные были готовы пойти ради того, чтобы в их родной стране наступил долгожданный мир.
Оказалось, что пламя гражданской войны вспыхнуло по одной простой причине - Беликовой нужны были все ресурсы ВСР, а часть их находилась на стороне повстанцев. Развязав кровавое сражение под предлогом борьбы с терроризмом, президент была готова уничтожать своих сограждан ради пополнения государственного бюджета.
Леон намеревался положить конец этому кошмару.