Вместе с другом Романом Протасевичем, её задержали в Минске при посадке самолета, летевшего из греческих Афин в Вильнюс.
В международном аэропорту Минска 23 мая 2021 года совершил экстренную посадку самолет авиакомпании Ryanair, выполнявший рейс из греческих Афин в Вильнюс. На борту самолета летели бывший главный редактор телеграм-канала NEXTA Роман Протасевич и его подруга Софья Сапега. Пассажиров задержали и арестовали. Целый месяц их держали в камерах следственного изолятора №1.
Позднее, гражданке России Софии Сапеге предъявили обвинение сразу по семи статьям уголовного кодекса Белоруссии. Её подозревали в разжигании социальной вражды и розни, в незаконных действиях в отношении информации о частной жизни и персональных данных, которые она выкладывала в телеграм-канале, где редактором был Роман Протасевич.
Также девушке инкриминировали вмешательство в деятельность сотрудников органов внутренних дел Беларуси. Сапега виновна в организации угроз в отношении сотрудника правоохранительных органов республики, который выполнял служебные обязанности.
В январе 2022 года документы уголовного дела на Софию Сапега поступили в Гродненский областной суд. Четыре месяца шли судебные разбирательства, в результате которых областной суд приговорил гражданку России Софию Сапегу к шести годам лишения свободы с отбыванием наказания в исправительной колонии строгого режима.
В настоящий момент приговор в законную силу не вступил и может быть обжалован в установленном законом порядке.