Алексий Семенович Скоробогатов родился в 1889 г. в Солнечногорском уезде Московской губернии, происходил из простой семьи, его отец был садовником.
В 1909 г. Алексей сдал экстерном экзамен во второклассной учительской школе, после получения педагогического образования трудился учителем. В 1915 г. он был мобилизован на военную службу, служил в армии в чине подпоручика.
В 1918 - 1921 гг. Алексей Семенович находился в красной армии в качестве переписчика, делопроизводителя, затем был младшим помощником начальника штаба дивизии по хозяйственной части. После демобилизации в 1921 г. Алексей Семенович проживал в Рузском районе Московской области. Будущий мученик был женат на Наталье Сергеевне Голубевой (1890 г.р.), в семье было трое детей: Валентина, Анна и Иван. Алексей Семенович служил псаломщиком в церкви св. Иоанна Предтечи в селе Ащерино (ныне Сумароково). Во время коллективизации в конце 1920-х гг. у семьи отобрали дом, лошадь и корову. В 1930-е гг. семья переехала в поселок Иваново Рузского района Московской области. Здесь Алексей Семенович заведовал школой.
Беда в семью пришла в годы Большого террора. 22 января 1938 г. мученик Алексий был арестован за «контрреволюционную агитацию». Алексей Семенович виновным себя не признал. Дело было столь грубо сфабриковано, что руководство НКВД вернуло его на доработку, предписав допросить новых свидетелей. Дело было доведено до конца. 8 марта 1938 г. мученик Алексий был приговорен к расстрелу. 5 апреля страдалец был расстрелян и похоронен в общей могиле на Бутовском полигоне под Москвой.