Ученые разработали мини-антитела, используя программное обеспечение, которое предсказывает, как сворачиваются белки. Антитела хорошо связываются с белками (например, с разными микробами), поэтому фармацевтические компании используют их для создания лекарств против инфекции и онкологии.
Процесс, когда антитела связываются с мишенью, похож на то, как скалолаз пытается взобраться на отвесную скалу, поверхность у которой гладкая, а опор для рук и ног мало. Антитела большие, поэтому они могут одновременно делать много захватов и держаться твердо. У мини-антител возможностей меньше. Исследователи попытались преодолеть этот недостаток — они определили места захватов на белках. Чтобы создать карту потенциальных точек опоры, исследователи обратились к ПО Rosetta. Программе было поручено рассчитать, насколько плотно определенные аминокислоты будут связываться с различными точками на поверхности целевого белка. В итоге были созданы десятки тысяч виртуальных мини-антител.
Такое программное обеспечение позволит исследователям разрабатывать диагностические зонды, которые помогут выявлять различные заболевания на ранних стадиях. Также можно сконструировать белки так, чтобы они связывались с любой мишенью: мини-протеины могут не только блокировать болезнетворные белки, но и, например, направлять лекарства в любые клетки целевым образом. Аналогичным образом можно будет и отслеживать прогресс в лечении.