История легендарного Учихи начинается в те времена, когда деревень ещё не существовало. Это были те времена, когда существовали различные кланы, враждующие между собой. Это были времена когда на войне сражались даже дети. Это был мир вечных войн. Мадара и его братья воспитывались по суровым правилам шиноби. Из всех его братьев остался Изуна.
Он поклялся защищать его не смотря ни на что. В возрасте 11-12 лет, на берегу реки, он встречает мальчика по имени Хаширама, который отказывается из враждебного клана Сенджу.
Мадара и Хаширама не раскрывая своих фамилий играются, тренируются и в конце концов просто весело проводят время, делясь своими мечтами о будущем. В будущем Мадара и Хаширама хотят создать мир без войн, где все будут жить счастливо и построить деревню которая объединит множество кланов. Они даже не подозревают что младшие братья Мадары и Хаширамы следят за ними и докладывают всё своим отцам. Каждый из своих отцов говорит своим сыновьям, Мадаре и Хашираме, чтобы они сразились на смерть. Мадара отказывается от этого и убегает к тому месту где он встретился с Хаширамой. Хаширама тоже прибежал к этому месту.
Передав записки друг другу они, поняв друг друга, решаются убежать, но вдруг из отцы и братья встретились лицом друг с другом. В этот момент находясь в эмоциональном состояние Мадара пробуждает шаринган. Его отец и брат были рады этому событию. Мадара посмотрев на Хашираму холодным и враждебным взглядом ушёл. Они уже не были друзьями, они стали врагами. Вскоре он стал главой клана и пробудил мангекё шаринган.
Война между двумя сильнейшими кланами, Учиха и Сенджу не прекращалась. В одной из битв Изуна сражался с братом Хаширамы Тобирамой. Инициатива была на стороне Изуны, но Тобирама использовав свою новую технику, технику мгновенного перемещения серьёзно ранил Изуну. Мадара пришлось отступить. Вернувшись домой Изуна погибает.
Мадара опечаленный жаждет мести и пересаживает глаза брата себе, тем самым заполучив вечный мангекё шаринган.
Уже в следующей битвы Хаширама замечает что с Мадарой что-то случилось. Мадара использует Сусано, технику мангекё шарингана, технику которую почти невозможно освоить. В битве явно перевес сил на стороне Мадары. Со клановцы Мадара радуются победе, но вдруг, используя свои древесные техники, Хашираме удаётся победить. Мадара лежит раненый, а его со клановцы сдались. Когда Тобирама захотел убить Мадару Хаширама его остановил, сказав что не кому не позволит его убить. Хаширама предлагает белый мир, но Мадара отказывается, говоря что согласится на мир если Хаширама или Тобирама умрут. Хаширама не колеблясь хочет убить себя, Мадара видя его решимость останавливает его и соглашается на мир.
Объединившись Мадара и Хаширама строят деревню, которую назвали Коноха. Пост Хокаге должен был занять Мадара, но Тобирама не желая видеть Мадару главным, ставит на пост Хокаге Хашираму. Мадара понимал, что ему не доверяют срывает союз с деревней Скрытого камня, а потом сбегает, становясь первым беглым ниндзя. С помощью своих глаз он подчиняет себе Девятихвостого Лиса. Захватив зверя он решает напасть на Коноху, но на пути встаёт временно подоспевший Хаширама. Между ними начинается битва, легендарная битва вошедшую в историю.
Мадара комбинирует Сусано и Девятихвостого, а Хаширама использует своего древесного голема и дракона.
Во время битвы они ведут диалог, Хаширама просит Мадару остановится, что они могут снова стать друзьями. Мадара понимает что пути назад больше нет. Хаширама с огорчением посмотрев на Мадару использует свою легендарную технику, технику Тысячи рукой Истины.
Тысячи кулаков полетели Мадару, разрушая броню Сусано. Дальше они встретились в ближнем бою. Мадара проткнул Хашираму мечом и думал что он победил, но Хаширама использовал древесного клона и уже сам в спину проткнул его мечом, убивая как он думал Мадару.
Мадара знал что он не выиграет использовал Изанаги. На самом деле планом Мадары было уничтожение Конохи, а заполучение частицы силы Сенджу. Во время битвы он смог откусить кусок от Хаширамы. Вернувшись в убежище он пересадил себе клетки Хаширамы. Вскоре он пробудил Риннеган, призвал статую Гедо и подключился к ней.
Всё оставшиеся время он продумывал план, смог просчитать рождение Нагато, Обито создал как он думал Зетсу. Его план Глаз Луны должен был обратить весь мир в Вечное Цукиёми, чтобы создать мир без идеальный мир без воин. Когда он смог заполучить Обито и изменить его мировоззрение, он отключился от стати Гедо и уже будучи глубоким стариком умер.
Прошло уже очень много времени, Кабуто, заполучив ДНК Мадары смог воскресить его, чтобы тот уничтожил 4-ый отряд альянса шиноби.
Мадара, разминаясь, в пух и прах разносит 4-ый отряд, используя огненные техники и Сусано.
Последних оставшихся он добивает двумя метиоритами. Когда осталось несколько выживших, он решает добить оставшихся древесными техниками, но вдруг Наруто тратя последние силы спасает всех.
Единственными кто считает себя достойными сразится с Мадарой являются пятёрка каге, сильнейшие из ныне живущих.
Они думали что Мадара сражается на все 100% и думали что смогли его победить. Но Мадара решил показать свою истинную силу, использует настоящий Сусано с одного удара побеждая каге.
Доведя пятёрку каге до состояние полу смерти, приходит на помощь Обито. Они призывают Десятихвостого. Обито решает стать джинчурики, а Мадара встречает, воскрешённого как и он, Хашираму, реванш с которым он так давно ждал. Они снова встречаются в битве.
Мёртвый не может умереть, не может вкусить вкус крови. Зетсу сливаются с проигравшим Обито и воскрешают уже по настоящему Мадару. Теперь он может использовать свои силы на максимум. Побеждает Хашираму, Сая и Наруто. Тобирама тоже проиграл ему, а Саске он проткнул мечом оставив его умирать. И уже он стал джинчурики биджу.
Единственный кто мог хоть как то противостоять ему оказался Гай, который открыл 8 врат. Мадара был рад по истине сильному противнику, даже назвав его сильнейшим. Гай наносил один удар за другим. Гай смог дать достойный бой Учихе, но всё равно не смог победить его.
Но вдруг появляются Наруто и Саске, которые заполучили силу Мудреца Шести Путей. Вместе они напали на Мадару и дали равный бой Учихе.
Но Мадаре удалось пробудить Третий Глаз, использует технику Цукиёми, и думая что он победил радуется победе.
Но мир без войн который желал Мадара оказался ложным. Оказавшись марионеткой в руках Чёрного Зетсу, который нанёс удар в спину пробуждая свою создательницу Кагую.
Мадару выплёвывает сгусток чакры хвостатых. Мадара умирает и ему уже не помочь. К нему подходит Хаширама и он ведёт со своим заклятым врагом диалог. Еле дыша он соглашаясь на последок остаться друзьями, после чего он уже навсегда закрывает глаза.