Вследствие того, что никто и никогда больше не видел Александру и ее детей, версия о гибели всей семьи стала общепринятой, и в нее все поверили. А различных претендентов на роль переживших эту ужасную трагедию считали самозванцами.
Бывшему следователю МВД и известному сценаристу Гелию Рябову удалось в конце 70-х годов разыскать детей Якова Юровского. Сын Юровского передал Рябову секретный отчет с подробным описанием захоронения тел. В отчете говорилось, что трупы действительно изуродовали и сбросили вместе с ручными гранатами в ствол заброшенной шахты, однако взрывы не привели к ее завалу. Поэтому Юровский, опасаясь, что наступающие белые найдут тела, приказал вырыть их и перенести в другое место.
Рябов решил самостоятельно разыскать останки царской семьи. Чтобы не привлекать лишнего внимания, он вел раскопки по ночам, ему помогали местные энтузиасты – геолог и историк. Поиски велись при помощи старых карт. Вскоре были найдены первые кости со следами кислотных ожогов. Первонаходцы, однако, после осмотра останков заново их закопали. Рябов опубликовал отчет о своих находках в 1988 году. Официальное подтверждение стало возможным только после того, как археологи провели на этом месте раскопки в 1991 году. Было извлечено девять скелетов. Были проведены соответствующие исследования, анализ генов. Проба крови была взята у принца Филиппа (супруга английской королевы Елизаветы II), бабушка которого по материнской линии приходилась сестрой бабушке царицы Александры.
Анализ показал полное совпадение генов, так были идентифицированы скелеты Александры и трех ее дочерей. В 1993 году был идентифицирован череп Николая. В 1998 году останки членов семьи были перезахоронены в Петропавловском соборе. Останки царевича Алексея и великой княжны Марии были найдены лишь в 2007 году.
Русская православная церковь до сих пор не признала подлинность найденных останков, сообщается, что вопрос признания предположительно будет решаться в мае 2022 года.