1 февраля 2003 года незадолго до окончания 28-го полёта шаттла «Колумбия» миссии STS-107 произошёл взрыв корабля, который привёл к гибели всего экипажа. При старте кусок теплоизоляции кислородного бака отвалился и упал на левую плоскость крыла, что привело к разрушению теплозащитного слоя.
Во время снижения в атмосфере раскалённые газы проникли внутрь, левая стойка шасси перегрелась, пневматика сдетонировала, крыло было разрушено. Челнок развалился на обломки, команда погибла. Среди жертв — первый астронавт Израиля, лётчик-истребитель Илан Рамон.
Гибель «Колумбии» привела закрытию программы многоразовых транспортных космических систем NASA. 8 июля 2011 года был осуществлён последний старт «Атлантиса» с сокращённым до четырёх человек экипажем по программе снабжения МКС. Это был последний полёт по программе «Спейс шаттл». Все оставшиеся шаттлы были списаны и отправлены в музеи.