Основан в 1941 году на базе эвакуированных Запорожского комбайнового завода «Коммунар» и Люберецкого завода сельскохозяйственного машиностроения имени А. В. Ухтомского.
В октябре 1941 года в Красноярск начали прибывать первые эшелоны с оборудованием.
В слободе III Интернационала поставили зимние палатки для размещения строителей и прибывших рабочих.
17 ноября 1941 года принято постановление СНК СССР о восстановлении производства комбайнов и зерноочистительных машин в Красноярске. В декабре 1941 года была выпущена первая продукция для фронта — снаряды и мины. В первой половине 1942 года завод начал выпускать миномёты и боеприпасы.
До 1944 года выпускал запасные части к сельскохозяйственным машинам. 26 октября 1944 года начался выпуск первых прицепных комбайнов. В 1944 году завод выпустил первые 10 комбайнов «Красноярский коммунар», к 1 мая 1945 года — уже 350 шт. С 1945 года завод первым в стране начинает производство самоходных комбайнов.
С 1969 года выпускаются комбайны собственной конструкции. Максимальный выпуск комбайнов был достигнут в 1986 году, тогда было произведено 16 534 машины[2]. Всего к 2009 году завод произвёл более 700 тысяч комбайнов.
Самая известная разработка завода - комбайн зерноуборочный самоходный класса 4 «Енисей КЗС 950» и его модификации.
За всё время существования завода выпущено более 700 тысяч комбайнов. Комбайны поставлялись на внутренний рынок и на экспорт в такие страны, как: Болгарию, Китай, Вьетнам, Ирак, Мексику и другие страны.
В феврале 2013 года объявлено о предстоящем закрытии завода. На площадках Красноярского завода комбайнов в исторической части города (участок площадью 20 га ориентировочной стоимостью $40-60 млн.) планируется реализовать крупный проект по строительству недвижимости. К марту 2018 года здания цехов Красноярского завода комбайнов были снесены. В результате ликвидации завода были уволены более 600 человек.
