После событий фильма "Темный рыцарь" Бэтмен стал разыскиваемым преступником, взяв на себя ответственность за преступления Харви Дента и убийство Дента. Когда розыск, который ведет полиция Готэма, не приносит результатов, это привлекает внимание всей страны, и правоохранительные органы решают вмешаться.
Специальный агент ФБР Эдвард Нигма привлекается для помощи полиции Готэма. Нигма - лучший из лучших - человек, поймавший многих самых известных преступников, беглецов и террористов. Он человек, который живет ради охоты и раскрытия дела. Расследование Нигмы вскоре приводит его к убеждению, что Бэтмен может быть невиновен в предъявленных ему обвинениях, но Нигма также обнаруживает гораздо более серьезную задачу, чем поимка убийцы Харви Дента. Он хочет разоблачить Бэтмена. Но Нигме недостаточно просто поймать Бэтмена, он хочет перехитрить его, он должен стать тем, кто разгадает тайну Бэтмена - это единственный способ доказать, что он величайший в мире детектив.
Для Нигмы цель оправдывает средства, и вскоре он начинает играть по обе стороны закона в смертельной попытке измотать Бэтмена и раскрыть человека, скрывающегося за маской. Нигма заручается помощью нескольких беглецов из психушки Аркхэм, превращая город Готэм в свою личную шахматную доску. По мере того как одержимость Нигмы растет, Бэтмен оказывается вынужден противостоять Нигме на его собственных условиях в опасной игре, в результате которой Готэм может сгореть дотла...
Бэтмен: Кукловод" - это короткометражный фан-фильм, действие которого происходит во вселенной "Темного рыцаря" Кристофера Нолана. Сюжет задуман как продолжение "Темного рыцаря" и происходит между этим фильмом и "Темным рыцарем". Это фильм, созданный фанатами для фанатов, и он предлагает захватывающий сюжет, который познакомит фанатов с новыми версиями Мистера Зсаша, Чревовещателя, и Эдварда Нигмы (он же Риддлер), которого фанаты ожидали увидеть в третьем фильме Нолана о Бэтмене.