Ягода состоит из шести слоев — кожица, мякоть, клейковина, пергаментная оболочка (пачмент), серебряная кожица (сильверскин) и зерно. Изменениям подвергаются первые четыре слоя ягоды. Натуральная обработка - это самый старый из методов. Тогда еще кофе производили только две страны - Эфиопия и Йемен. Благодаря их сухому климату кофейные ягоды хорошо сушились на открытом воздухе. При натуральной обработке кофейная ягода сушится на так называемых африканских кроватях - специальных столах с сеткой. Процесс занимает от 2х до 4х недель. сушатся они примерно до 12-13% влажности. Ягода сохнет вместе с зерном. Cахара из мякоти и клейковины остаются в зерне. Поэтому при схожих условиях зерно после натуральной обработки дает более плотное тело и сладость. В какой то период времени натуральная обработка ассоциировалась с дешевым кофе, потому что дешевый кофе чаще так и обрабатывали. А отсутствие внимания к процессу обработки приводило к еще большим дефектам. В пору третей волны натуральная обработ