На фоне нагнетающих панику новостей о победном шествии ковида в Европе и Америке малозамеченными остались вселяющие оптимизм известия из Африки и Юго-Восточной Азии. Российские СМИ сообщили о выводах японских ученых с большой дозой скептицизма. Вот что об этом написало одно из российских интернет-изданий:
«Планету облетела новость, что в Японии самоликвидировался дельта-штамм вируса COVID-19, в связи с чем снизилась заболеваемость. Версию о причине исчезновения вируса высказал профессор Национального института генетики Итуро Иноуэ в разговоре с изданием Japan Times.
Он предположил, что данный подвид исчез из-за постоянных мутаций, которые и «сломали» дельта-штамм коронавируса.
Помимо этого, заболеваемость в Японии могла снизиться благодаря высоким показателям вакцинации и соблюдению мер по защите от инфекции.
Страна била рекорды суточной заболеваемости на протяжении трех месяцев: число заболевших достигало 26 тысяч. В настоящий момент этот показатель едва достигает 200 случаев.
Российский вирусолог, доктор медицинских наук, профессор кафедры инфектологии и вирусологии Института профессионального образования Сеченовского университета Анатолий Альтштейн также оценил вероятность самоликвидации дельта-штамма коронавируса. По его мнению, это маловероятно, однако рациональное зерно в теории японских ученых есть».
Хочу представить читателям мой перевод статьи из японского издания JapanTimes, которое опубликовало мнения ученых о причинах прекращения эпидемии коронавируса в Японии. Оригинал статьи можно прочитать по ссылке https://www.japantimes.co.jp/news/2021/11/18/national/delta-variant-self-destruction-theory/
Что стоит за быстрым исчезновением дельта-варианта в Японии? Это могло быть самоуничтожением.
Осаму Цукимори JapanTimes за 18 нояб.2021 г.
Почему пятая и самая большая волна пандемии коронавируса в Японии, вызванная сверхзаразным вариантом дельты, внезапно прекратилась после, казалось бы, неумолимого роста новых инфекций? И что отличает Японию от других развитых стран, в которых сейчас наблюдается новый всплеск новых случаев заболевания? По мнению одной группы исследователей, удивительный ответ может заключаться в том, что дельта-вариант позаботился о себе в акте «самоуничтожения». Спустя три месяца после того, как дельта-вариант привел к рекордной ежедневной заболеваемости по всей стране, составляющей почти 26000, количество новых случаев заражения COVID-19 в Японии резко упало, упав ниже 200 за последние недели. Обращает на себя внимание тот факт, что 7 ноября не было зарегистрировано ни одного случая смерти - впервые за 15 месяцев.
Многие ученые указывают на множество возможных причин, в том числе на то, что в Японии один из самых высоких показателей вакцинации среди развитых стран: по состоянию на 17 ноября 2021 года 75,7% жителей были полностью вакцинированы. Другими потенциальными причинами снижения эпидемии являются социальное дистанцирование и соблюдение требований ношения масок, которые сейчас глубоко укоренились в японском обществе.
Но главная причина может быть связана с генетическими изменениями, которые коронавирус претерпевает во время размножения, примерно с двумя мутациями в месяц. Согласно потенциально революционной теории, предложенной Итуро Иноуэ, профессором Национального института генетики, дельта-вариант в Японии накопил слишком много мутаций в исправляющем ошибки неструктурном белке вируса под названием nsp14. В результате вирус изо всех сил пытался вовремя исправить ошибки, что в конечном итоге привело к «самоуничтожению». Исследования показали, что у большего числа людей в Азии есть защитный фермент APOBEC3A, который атакует РНК-вирусы, в том числе вирус SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19, по сравнению с людьми в Европе и Африке. Поэтому исследователи из Национального института генетики и Университета Ниигаты решили выяснить, как белок APOBEC3A влияет на белок nsp14 и может ли он подавлять активность коронавируса. Команда провела анализ данных генетического разнообразия для альфа- и дельта-вариантов инфицированных клинических образцов в Японии с июня по октябрь 2021 года. Затем они визуализировали отношения между последовательностями ДНК вируса SARS-CoV-2, чтобы показать генетическое разнообразие на диаграмме, называемой сетью гаплотипов. В целом, чем больше сеть, тем больше положительных случаев она представляет.
Сеть альфа-варианта, который был основным двигателем четвертой волны в Японии с марта по июнь, состояла из пяти основных групп с множеством разветвленных мутаций, что подтверждает высокий уровень генетического разнообразия. Исследователи думали, что дельта-вариант, который, по данным Центров по контролю и профилактике заболеваний США, более чем в два раза более заразен, чем предыдущие варианты и может вызывать более тяжелые заболевания у непривитых людей, будет иметь гораздо более яркое генетическое разнообразие. Удивительно, но они обнаружили обратное. В сети гаплотипов было только две основные группы, и мутации, казалось, внезапно остановились в середине процесса ее эволюционного развития. Когда исследователи продолжили исследование фермента вируса, исправляющего ошибки (nsp14), они обнаружили, что подавляющее большинство образцов nsp14 в Японии, похоже, претерпели множество генетических изменений в участках мутации, называемых A394V.
«Мы были буквально шокированы, увидев результаты», - сказал Иноуэ The Japan Times. «Вариант дельты в Японии был очень распространен и не допускал других вариантов. Но по мере того, как мутации накапливались, мы полагаем, что в конечном итоге он стал неисправным вирусом и не смог копировать себя. Учитывая, что число случаев не увеличивается, мы думаем, что в какой-то момент во время таких мутаций он прямо направился к своему естественному исчезновению ». Теория Иноуэ, хотя и новаторская, может поддержать таинственное исчезновение распространения дельта-варианта в Японии. В то время как большая часть остального мира с таким же высоким уровнем вакцинации, включая Южную Корею и некоторые западные страны, страдает от рекордных волн новых инфекций, Япония, похоже, является особенным случаем, поскольку случаи COVID-19 оставались подавленными, несмотря на поезда и рестораны, которые заполняются после окончания последнего чрезвычайного положения. «Если бы вирус был жив и здоров, число случаев заболевания наверняка увеличилось бы, поскольку в некоторых случаях маскировка и вакцинация не предотвращают прорывных инфекций», - сказал Иноуэ.
По словам Такеши Урано, профессора медицинского факультета Университета Симанэ, который не принимал участия в исследовании, действительно, неожиданное резкое сокращение числа новых случаев после летней волны стало горячей темой для обсуждения среди многих экспертов, в том числе тех, кто не проводил исследования коронавируса. исследование под руководством Иноуэ. «Nsp14 работает с другими вирусными белками и выполняет критическую функцию по защите вирусной РНК от разрушения», - сказал он, отвечая на вопрос о выводах Иноуэ. «Исследования показали, что вирус с поврежденным nsp14 имеет значительно сниженную способность к репликации, поэтому это может быть одним из факторов быстрого снижения числа новых случаев. Nsp14 происходит от вируса, и химическое средство для сдерживания этого белка может стать многообещающим лекарством, разработка которого уже ведется ». Япония кажется аномалией в том смысле, что дельта-вариант практически исключил альфа и другие варианты к концу августа. С другой стороны, другие страны, включая Индию и Индонезию, которые особенно сильно пострадали от дельта-варианта, сообщили о смешении альфа- и дельта-штаммов среди случаев. По словам Иноуэ, подобное естественное исчезновение коронавируса могло бы наблюдаться за границей, добавив, что обнаружить это будет сложно, поскольку ни одна другая страна, похоже, не накопила столько мутаций в nsp14 вируса, сколько в Японии, хотя аналогичные мутации на участке генома вируса A394V были обнаружены как минимум в 24 странах.
Но теория Иноуэ может также помочь объяснить, почему вспышка тяжелого острого респираторного синдрома (SARS) внезапно прекратилась в 2003 году. Эксперимент in vitro, в котором исследователи вызвали мутации nsp14 в вирусе, вызывающем SARS, привел к выводам, что вирус в конечном итоге не может воспроизводятся по мере накопления мутаций. «Данных о геноме не существует, поэтому это всего лишь гипотеза, но поскольку она исчезла, она никогда больше не увидит свет», - сказал он. Итак, каковы шансы, что мы можем увидеть подобное естественное исчезновение за границей вируса SARS-CoV-2, вызывающего COVID-19? «Шансы не равны нулю, но на данный момент это кажется слишком оптимистичным, поскольку мы не можем получить никаких подобных доказательств, хотя мы изучили различные данные по другим странам», - сказал он. С момента пика в середине августа ежедневные случаи заболевания COVID-19 в Японии продолжали снижаться, упав до уровня ниже 5000 к середине сентября и ниже 200 к концу октября. По словам Иноуэ, в стране в течение некоторого времени наблюдается один из самых низких уровней инфицирования среди всех развитых стран, но она не застрахована от следующей волны пандемии.
«Очевидно, что по-прежнему существует угроза новой волны», - сказал он. «У нас все было хорошо, потому что был вариант дельты. Постепенно подкрадывались и другие варианты, но дельта в Японии удерживала их. Но поскольку теперь нет ничего, что могло бы их сдерживать, есть место для новых штаммов, поскольку вакцины сами по себе не решат проблему. В этом смысле я думаю, что карантинные меры для иммиграционного контроля очень важны, потому что мы никогда не знаем, что приходит из других стран ». Некоторые люди могут задаться вопросом, было ли самоуничтожение дельта-варианта в Японии чем-то особенным в генетическом составе японцев, но Иноуэ с этим не согласен. «Я так не думаю, - сказал он. «Люди в Восточной Азии, такие как корейцы, этнически такие же, как японцы. Но я не знаю, почему это явление наблюдалось именно в Японии ». Иноуэ сказал, что группа исследователей из Национального института генетики и Университета Ниигаты планирует к концу ноября подготовить исследование, посвященное своим открытиям.