Несмотря на видимое сходство форм рыб, ракообразных и моллюсков с формами, существующими в других океанах, сравнение фауны' этой части Индийского океана с соседними фаунистическими областями, а также с представителями прежних геологических эпох, не легко: дело в том, что это сходство редко доходит до полного тождества, причём вследствие эволюционной гибкости морских организмов между ними существуют многочисленные и подчас весьма тонкие морфологические различия. А. Алькок тем не менее попытался произвести такое сравнение в отношении рыб на основании материалов, собранных в открытом океане экспедицией «Инвестигейтора» в течение пятнадцатилетних её исследований между 5° и 24° с. ш. и 65° и 99° в. д., т. е. на востоке Оманского моря и во всём Бенгальском заливе. В отношении глубоководных рыб он установил, что из 169 изученных видов 23 вида встречаются и в Индийском и в Атлантическом океанах; среди ших много видов Macrurus, этих космополитических батипелагических рыб, 20 других видов являются индо-тихоокеанскими; Алькок утверждает, что многие из этих форм распространились из средиземного третичного бассейна, причём они позволяют установить распространения этого бассейна с востока на запад на пространства морей Индии, современных континентов и за их пределами. Из рыб как поверхностных вод, так и глубоководных было изучено 350 родов, причём^ 56% из них оказались общими для морей Индии, Атлантического океана и Средиземного моря. Если многие из этих -родов (меч-рыба, тунец, лоцман) относятся к океаническим формам, встречающимся повсеместно, то нельзя сказать того же про многие другие формы, характеризующие обширную атлантикоиндийскую биологическую провинцию. Географическое распространение знаменитого амфиоксуса, вызывающего такой интерес у натуралистов, приводит к ещё более широким заключениям. Это животное встречается в тропических и умеренных частях Атлантического океана, в Средиземном море, у берегов Индии и Цейлона, а также в тропических и умеренных частях Тихого океана. Когда Индийский океан .стал частично межматериковым, эта изоляция усилила влияние местных условий, правда, не в отношении родов, а в отношении видов: общих Индийскому и Атлантическому океанам и Средиземному морю из 1200 видов рыб оказывается только 5%.