В Центральном регионе центральной и западной части Хонсю доминирует объединение Северо-Восточной, Юго-Западной и Шичито-Мариана горных дуг в районе горы Фудзи. Направления гор, низменностей и вулканических зон пересекают остров почти под прямым углом. Наиболее заметной физической особенностью является Фосса Магна, большая рифтовая низменность, которая пересекает самую широкую часть Хонсю от Японского моря до Тихого океана. Она частично занята горами и вулканами южной части Восточно-Японского вулканического пояса. Межгорные бассейны находятся между высокими, частично оледеневшими центральными горными узлами хребтов Акаиси, Кисо и Хида (которые вместе образуют Японские Альпы) на западе и хребтом Канто на востоке. Неглубокая структурная котловина равнины Канто, простирающаяся к востоку от хребта Канто, является самой обширной низменностью Японии; огромный мегаполис Токио простирается из ее центра, занимая огромную площадь равнины. Юго-западный регион, включающий западную часть Хонсю (Чуго