Однако после битвы шторм помешал афинским военачальникам остаться, чтобы забрать погибших с двадцати пяти потерянных кораблей. Демократическая ассамблея в ответ обвинила генералов в нечестии и казнила их. Эта процедура была совершенно неконституционной, как пытался указать философ Сократ, который оказался одним из тех, кто председательствовал на заседании Ассамблеи в тот день: афиняне не могли быть приговорены к смертной казни Собранием, а только судом. Казнь генералов, один из которых на самом деле был сыном великий полководец Перикл имел катастрофические последствия для военных перспектив Афин, которые и без того были сомнительными после отставки Алкивиада. Афины просто не обладали достаточной глубиной стратегического таланта, чтобы позволить себе потерять этих людей.
Спартанский полководец Лисандр воспользовался провалом афинской стратегии в Геллеспонте, чтобы застать афинский флот врасплох и уничтожить его в битве при Эгоспотами в 405 году. Только двадцати из 180 афинских корабле