Спустя всего месяц после начала войны, 21 июля 1941 г., рвавшиеся к северной столице гитлеровцы вошли в Уторгошский район. К концу июля они заняли Белебёлковский, Волотовский, Солецкий районы. В августе под пятой захватчиков оказались Батецкий, Залучский, Поддорский, Полавский, Старорусский, Чудовский и Шимский районы, в сентябре— Демянский, Лычковский, Молвотицкий. К октябрю они заняли почти весь Новгородский район и часть Дрегельского, Маловишерского и Мстинского. Таким образом, из 27 районов будущей Новгородской области оказались оккупированными полностью 14, состоявшие из 237 сельсоветов, частично— 4 и 30 сельсоветов. Свободными остались 9 восточных районов: Боровичский, Валдайский, Крестецкий, Любытинский, Мошенской, Окуловский, Опеченский, Пестовский и Хвойнинский. Из трех частично оккупированных районов немцев изгнали в декабре 1941 г. В феврале 1943 г. в ходе наступления Северо-Западного фронта были освобождены 5 районов— Демянский, Залучский, Лычковский, Молвотицкий и Полавский. Другие территории ждали освобождения еще ровно год, до наступления Волховского фронта. Полностью новгородская земля была очищена от оккупантов к концу февраля 1944 г. Ее южные и западные районы представляли зону пустыни. Сожженные города и деревни, разрушенные предприятия, разграбленные колхозы. Значительная часть населения насильственно вывезена на Запад.
Батецкий район
д. Большой, Латовец, д. Бор, пос. Волынка, с. Воронцово. д. Гастухово,
д. Дехова, д. Дрегли, д. Жили, д. Заболотье, д. Заолешье, пос.Изворожно, д. Кельяши, д. Козметино, пос. Кошельково, д. Крючково, д. Лабажино, д. Лужа, д. Малый Латовец, д. Мыселка, д. Пневно, д. Радгостицы, д. Рождественно, д. Ташино, д. Удрино, д. Холуи, д. Хрипле.
Белебёлковский район
д. Беседки, д. Большая Коровинка, д. Большое Пухово, д. Бычково, д. Великое Село, д. Вязовка, д. Глотово, д. Гривки, д. Кстечки, д. Краснодубье, д. Леша, д. Малая Коровинка, д. Малое Пухово, д. Папоротно, д. Починок, д. Семёновщина, д. Серболово, д. Шкворово.
Волотовский район
д. Веретье, д. Вдули, д. Взгляды, д. Выдра, д. Вязовня, д. Гниловец д. Горка, д. Городок, д. Гривы, д. Дерглец, д. Должино, д. Дубовец, д. Жуково-Дуброво, д. Заполосье, д. Заречье, д. Ивье, д. Касковка, д. Каськово, д. Клевицы, д. Косткино, д. Костыгово, д. Кривицы, д. Личино, д. Луково, д. Лухино, д. Междуречье, д. Мостище, д. Никулино, д. Окроево, д. Песьева, д. Петрово, д. Поглездово, д. Подсосонье, д. Псюшка, д. Рябково, д. Селиваново, д. Сельцо, д. Славитино, д. Станишино, д. Старо, д. Точново, д. Тюриково, д. Уницы, д. Учно, д. Шилова Гора, д. Шур.
Демянский район
д. Большое Опуево, д. Малое Опуево, д. Новые Ладомири, д. Палагино, д. Тараканница.
Залучский район
д. Березовец, д. Большое Засово, д. Большое Князево, д. Большое Старо, д. Большое Стречно, д. Большой Остров, д. Будомицы, д. Бяково, д. Ваньково, д. Великое Село, д. Верехница, д. Веруни, д. Верясско, д. Выстово, д. Гадово, д. Гарь, д. Годилово, д. Горбы, д. Громково, д. Демидово, д. Дубки, д. Жирки, д. Закорытно, с. Залучье, д. Заробье, д. Заря, д. Зуевы Горки, д. Избитово, д. Извоз, д. Июдкино, д. Калиткино, д. Козлово, д. Кокорино, д. Коровитчино, д. Кузьмино, д. Кукино,
д. Кукуй, д. Кулаково, д. Лебединец, д. Липно, д. Лужки, д. Майлуковы, д.Горки, д. Малое Князево, д. Малое Старо, д. Малое Стречно, д. Матасово, д. Моклоково, д. Медведово, д. Межник, д. Местцы, д. Нижняя Сосновка, д. Никулино 1-е, д. Никулино 2-е, д. Новоселье, д. Новые Дегтяри, д. Ольгино, д. Остромы, д. Пинаевы Горки, д. Полуденник, д. Птицино, д. Пустошка, д. Рассолово, д. Речицы, д. Ростань, д. Рядово, д. Сорокопенно, д. Сосновка, д. Сотино, д. Старовские поселки, д. Старые Дегтяри, д. Суконниково, д. Сутоки, д. Сущино, д. Тарасино, д. Фомино, д. Хмели, д. Черенчицы, д. Чириковщина, д. Шелгуново, д. Шотово, д. Шубино, д. Шумилино.
Лычковский район
д. Алешенка, д. Баженка, д. Белый Бор, д. Большое Замошье, д. Борок, д. Бояры, д. Вершина, д. Вешки, д. Володиха, д. Выдерка, д. Высочек, д. Горелое, д. Горки, д. Горшковицы, д. Добрилово, д. Домаши, д. Дубровка, д. Ерушково, д. Заборовье, д. Замошка, д. Замошье, д. Запрудно, д. Злодари, д. Иловка, д. Ильина Нива, д. Калиты, д. Каменная Гора, д. Кипино, д. Кирилловщина, пос. Кневицы,
д. Копейник, д. Красея, д. Крутики (Плешевицы), д. Куяны, д. Липняги, д. Лобаново, д. Лонна, пос. Лычково, с. Лужно, д. Любница, д. Мелеча, д. Михальцово, д. Муры, д. Новинка, д. Охта, д. Подолы, д. Польцо, д. Починок, д. Соснино, д. Сосницы, д. Сухая Нива, д. Тесны, д. Уполозы, д. Хани, д. Хилково, д. Холмы, д. Черный Ручей, д. Чичилово, д. Яблонка, д. Язвищи, д. Ямник.
Маловишерский район
с. Александровское, пос. Большая Вишера, д. Веретье, д. Вишерка, д. Городище, д. Луга, д. Поздышево.
Молвотицкий район
д. Андреевское, д. Антоново, д. Бель 1-я, д. Бель 2-я, д. Большая Островня д. Бор, д. Будьково, д. Бутылдино, д. Вайно, д. Васильки, д. Великуша,
д. Волбовичи, д. Воскресенское, д. Врагово, д. Выдомерь, 1-я д. Выселок,
д. Глыбочица, д. Гусево, д. Гучево, д. Долматово, д. Дягелево, д. Заборовье 1-е, д. Заборовье 2-е, д. Заселье, д. Заселье 2-е, д. Казичино д. Корнево д. Кулотино д. Курилково д. Кушелово д. Латкино д. Леховод, д. Линье, д. Луковец, д. Лунево, пос. Любно, д. Любно, д. Малая Островня, д. Молвотицы, д. Мышкино, д. Наумово, д. Новая, Русса, д. Новый Новосел, д. Ожееды, д. Осняк, д. Павлово, д. Перелог, д. Печище, д. Поленовщина, д. Поля, д. Просеково, д. Пупово, д. Себежь, д. Сидорово, д. Смыково, д. Сопки, д. Старый Новосел, д. Стобня, д. Сысоево, д. Теплынька, д. Черное, д. Черные Луки, д. Шепелево, д. Шинково.
Новгородский район
д. Глухая Кересть, д. Горки, д. Дубровка, д. Змейско, д. Кшентицы, д. Лобково, д. Ляга, д. Малое Замошье, д. Мясной Бор, д. Никиткино, д. Новые Быстрица, д. Русса, д. Сельцо, д. Ситно, д. Старые Быстрица, пос. Тёсово-Нетыльский, д. Финёв Луг, д. Чауни.
Полавский район
д. Бабки, д. Беглово, д. Большая Ивановщина, д. Большие Дубовицы, д. Большие Роги, д. Большой Калинец, д. Быково, д. Васильевщина, д. Веретейка, д. Выползово, д. Высокуша, д. Георгиевщина, д. Голубово, д. Горбы, д. Горчицы, д. Гривка, д. Дрегло, д. Дубровы, д. Дуплянка,
д. Здринога, д. Зорянка, д. Колома, д. Круглышево, д. Кузьминское,
д. Курланское, д. Кутилиха, д. Лебедское, д. Лозницы, д. Малая Ивановщина д. Малые Дубовицы, д. Малые Роги, д. Малый Калинец,
д. Маслино, д. Махлюево, д. Милохово, д. Навилье, д. Налючи, д. Никольское, д. Новая, Деревня, д. Новоселье, д. Новые Горки, д. Норы, д. Обжино, д. Ольхи, д. Подборовье, д. Пожалеево, д. Пустыня, д. Радово, д. Рыкалово, д. Свинорой, д. Симаново, д. Сомшино, д. Сорокино,
д. Софронково, д. Старые Горки, д. Стрелицы, д. Точково, д. Туганово,
д. Уполозы, д. Учны, д. Черная, д. Ярцево.
Поддорский район
д. Гребло, д. Лопастино, д. Михалкино, д. Ольхи, д. Ямно.
Солецкий район
д. Абрамково д. Бережок д. Большая Грузометь д. Большое Данилово д. Большое Заборовье д. Быково д. Веретье д. Вёска д. Витебско д. Вязищи д. Городище д. Гряда д. Долга д. Заилеменье д. Заполье д. Илемно д. Казачий Лютец д. Клин д. Корсаков Клин д. Крапивно д. Крюково д. Лавров Клин д. Лопотуха д. Любитово д. Малая Гребня д. Малая Грузометь д. Малое Данилово д. Малое Заборовье д. Молочково д. Нивки д. Петрово д. Петровщина д. Порожки д. Посохово д. Ретно д. Рельбицы д. Сельцо д. Ситня д. Строкино д. Теребони д. Устье д. Фальки д. Шелонско пос. Шилова Горка д. Яхирево
Старорусский район
д. Великое Село, д. Григорово, д. Переволока, д. Сычево.
Уторгошский район
д. Бологово, д. Боровики, д. Веретейка, с. Видони, д. Заклинье, д. Кашино, д. Киевец, д. Казовицы, д. Красовицы, д. Людятино, д. Низы, д. Подмошье, д. Серебрянка, д. Сторонье, д. Турская Горка, пос. Уторгош.
Чудовский район
д. Александровская колония, д. Березовец, с. Большие Вяжищи, д. Большое Опочивалово, д. Борисово, д. Велье, д. Вергежа, д. Веселая, д.Горка, д. Водосье, ст. Волхово, д. Вылеги, д. Высокое, д. Выя, д. Гачево, д. Глушица, д. Горелово, д. Городок, д. Графская Слобода, пос. Грузино, д. Гряды, д. Деделево, д. Дубовицы, д. Дымно, д. Завище, д. Залазье, д. Заречье, д. Званка, д. Зеленцы, д. Каменная Мельница, д. Кипрово, д. Кова, д. Коломно, д. Коляжка, пос. Коминтерн, д. Костылево,
д. Кочково, д. Красная Горка, пос. Краснофарфорный, д. Красный поселок, д. Круг, д. Крупичино, д. Кузино, д. Курников Остров, д. Лезно, д. Лука I, д. Любино Поле, д. Любунь, д. Лядно, д. Малое Опочивалово, д. Малые Селищи, д. Марьино, д. Маслено, д. Метино, д. Михалево, д. Модня, д. Мостки, д. Мотылье, д. Нечанье, д.Новая Деревня, д. Новые Буреги, д. Овинец, д. Ольховка, д. Орелье, д. Оскуй, д. Остров Большелюбунского сельсовета, д. Остров Спасскополистьского сельсовета, д. Пересвет-Остров, д. Переход, д. Пертечно, д. Пехово, д. Порожки, д. Прилуки, д. Приютино, д. Пшеничище, пос. Селищи, д. Сивера, д. Слобода, д. Соснинка, д. Спасская Полисть, д. Старые Буреги, д. Стриженец, д. Трегубово, д. Тыркова Мыза, д. Ульково, д. Форверст, д. Хмелищи, д. Холопья Полисть, д. Хотитово, д. Шевелево, д. Ямно.
Шимский район
д. Бедрино, д. Закибье, д. Костково, д. Кукшино, с. Медведь, д. Отрадное, пос. Шимск.
