Классический взгляд на транскрипцию такой. Есть молекула ДНК и с некоторого гена (небольшого участка молекулы) надо снять копию. Гены состоят из некоторых последовательностей из нуклеотидов, главными в них являются пары азотистых оснований, объединенных по три штуки в так называемые триплеты.
Считается, что в молекуле есть 4 специализированных триплета, указывающих на начало и конец гена. Типа тегов или знаков препинания. Они не транскрибируются. АУГ – это старт-кодон. Он кодирует метионин и указывает на начало синтеза. Кодоны УАА, УАГ и УГА ничего не кодируют, указывают на конец гена.
Согласно молекулярной теории в клетке существуют некие белковые образования с некоторыми другими элементами, так называемыми топоизомеразами. Эти топоизмеразы каким-то образом находят эти реперные кодоны начала и конца гена и расплетают этот участок молекулы, где находится требуемый ген. Как полимераза среди более 20 000 генов находит требуемый ген пока неизвестно. Такой вопрос молекулярная биология не ставит и не ищет на него ответ. Вот, как на картинке,
Правда на этой картинке все действующие органы представлены, как внутренние органы РНК-полимеразы (RNA-polimerase). Вот механизм (DNA-is rewound) скручивающий ДНК, вот механизм (DNA is unwound) раскручивающий ДНК. Как можно получить такой раскрученный участок, двумя вращениями молекулы в одном и том же направлении, совсем не понятно. Возьмите любой свитой жгут и попробуйте его где-то в средине раскрутить. Это не простая задача.
В результате получилась кодирующая нить (Coding strand) и нить шаблона (Template strang). Как только образовалась нить-шаблон, сразу же некий механизм в РНК-полимеразе, определяя типы оснований, начинает подтягивать к этим основаниям соответствующие нуклеозидтрифосфаты (Nucleoside triphosphate, NTP). Надо же чтобы к цитозину на шаблоне присоединился NTP с гуанином, к аденину присоединился NTP с урацилом и так далее. Синтез белка идет в направлении 5’ → 3’, как утверждает наука.
Поэтому и получилась гибридная область ДНК – РНК (RNA DNA hybrid region). Какой величины эта область трудно понять.
Затем вся полимераза продвигается по молекуле и DNA is unwound раскручивает следующие витки ДНК. А в это время в гибридной области добавляются новые NTPs. Так продолжается до тех пор, пока в гибридной области не обнаружится стоп-кодон. На этом формирование иРНК заканчивается. Дальше она ищет свою рибосому или рибосома ищет ее. Это вопрос тоже не обсуждается.
Так же не понятно, что же происходит в это время на второй ветви молекулы? Она что? плывет, как в воздухе или каком-то растворе? Или для нее предусмотрен специальный канал? При репликации на обе ветви набрасываются полимеразы. А в случае транскрипции на одну.
Разве не может быть так, что и на кодирующей нити (Coding strand) тоже окажется какой-нибудь ген со своим старт-кодоном? Ведь очевидно, что на каждой молекуле торчат концы 3 и 5 со штрихами. С какого конца будет одеваться на молекулу? Или она найдет старт-кодон и затем обернется вокруг молекулы? Так ей все равно на какой ветви находится старт-кодон. Может она ориентируется по магнитному полю земли? Тогда и ДНК должна быть так сориентирована соответственно. Много вопросов, а ответов нет.
С этой такой не совсем понятной ситуацией у меня и возникает крамольная мысль. Может она бестолковая, глупая, смешная или еще какая, но она есть. Не может ли так статься, что одна из ветвей кодирует женский организм, а другая мужской?
Я знаю общепринятую точку зрения на эту ситуацию. Наука утверждает, что пол закладывается во время рекомбинации при слиянии яйцеклеток. Но удовлетворительного объяснения, как эта рекомбинация свершается, найти сложно. Можно найти длительность времени, сколько рекомбинация происходит. А как – неизвестно. Не может ли так произойти, что мужская и женская молекулы распались, веретено деления почему-то не образовалось и ветви отправились в свободное плаванье? А потом раздробились до генов и снова соединились по генно. Теперь собраться в начальный вид сложно. Женские и мужские элементы перепутались и попадание генов одной половины на другую половину вполне возможно. Так и может получится 2 смешанные молекулы ДНК. Они и представляют зиготу.