Генофонд — совокупность генов, которые имеются у особей данной популяции, группы популяций или вида.
При изменении внешней среды меняется генофонд популяции. Возникают новые наследственные изменения — мутаций , ведущие к появлению новых генотипов в популяции.
Колебания численности популяций могут быть вызваны сезонными изменениями, стихийными бедствиями (засухи, наводнения, пожары и т.д.). Эти популяционные волны меняют концентрацию отдельных генов, некоторые гены могут исчезнуть.
Географическая изоляция популяций создает преграды для свободного скрещивания и приводит к обособлению их генофондов. Охрана генофонда природных и искусственных популяций растений и животных — одна из центральных задач охраны живой природы.