Итак – зима 1598 года. После разыгранной партии с патриархом Иовом, Земский Собор присягает на верность, Годунов наконец-то становится законным царем. Свое официальное царствование Годунов начал с активного сближения России с западом. Он всегда благоволил европейским послам, а теперь вся внешняя политика Российского государства оказалась направлена на то, что бы страна заняла свое место среди сильнейших держав мира. В Москву пока еще тонкой, но постоянно увеличившейся струйкой, потянулись зарубежные купцы, врачи, ученые, военные. Они получали высокие должности и немалое жалование. Культура западной Европы все больше проникала в быт. Это касалось всего: одежды, жилья, церемоний. Началось строительство кремлевского водопровода. Более того, Борис Годунов еще за сто лет до Петра Великого начал сбривать бороды у своих сподвижников. Так же как Петр I, Борис Федорович посылал молодых боярских детей на учебу в Европу, у него возникали похожие проблемы. Бояре, отучившись, вкусив европейской жизни, зачастую отказывались возвращаться на родину.
Не принадлежа по крови к династии Рюриковечей, Годунов понимал шаткость своего положения. Более того новый царь отличался большой мнительностью. Стоит также учитывать тот факт, что своим положением он обязан церковнослужителям, а именно патриарху Иову. Ведь те кто дает власть, без сомнения ей обладает. Все это в совокупности привело к тому, что с момента своего воцарения Борис Федорович принялся активно избавляться от конкурентов, от тех бояр, кто по своему происхождению могли претендовать на престол. Так например князьям Мстиславскому и Шуйскому новый царь не позволял жениться. Одной из первых жертв Годуновских репрессий стал воевода Богдан Бельский, который по его же поручению строил новый город Царёв-Борисов. Обратив внимание на название, становятся еще более понятными побуждения Годунова. Прибывший по приказу в Москву Бельский подвергся оскорблениям и унижениям, и был сослан в Сибирь. По доносу также пострадали бояре Романовы, так Федор Никитич (отец первого русского царя династии Романовых) был сослан в Сийский монастырь, и пострижен под именем Филарета.
Череда опал и ссылок близких бояр породили всеобщее уныние, а вскоре разразилась настоящая катастрофа - Великий голод. Крайне неурожайный 1601 год, прозванный современниками годом без лета, когда затянувшиеся на два с половиной месяца дожди и ранняя, холодная осень погубили почти весь урожай. положил начало концу царствования Бориса Годунова. Из-за нехватки продуктов многие помещики выгоняли своих крестьян, просто, чтобы их не кормить. Тысячи голодающих устремились в Москву, где Годунов повелел раздавать милостыню. Другие холопы сбивались в банды и осадили все крупные дороги. Вслед за голодом пришел хаос. Монастыри в то время были крупнейшими держателями хлебных запасов. Накануне голода запасы одного только Вологодского Спасо-Прилуцкого монастыря составляли около 2 800 четвертей (1 четверть = 209 литров). В переводе на современную меру это примерно 500 тонн. Год спустя они сократились в три раза. Неурожай продлился до 1603 года. За это время только по официальным данным погибло от голода порядка 130-ти тысяч человек.
В России разгорелось восстание Хлопка, появились самозванцы. 13 апреля 1605 года Борис Годунов был отравлен и скоропостижно скончался, а вскоре после этого убивают его сына Федора. Династия Годуновых оказалась низложена. Россию поглотила смута.