Верхний пруд обладает искусственным происхождением. Пруд начал свою жизнь в 1270 году, когда рыцари Тевтонского ордена из расположенного рядом замка Кёнигсберг запрудили земляной дамбой речку-приток Преголи. Пруд использовался для разведения рыбы.
Верхний пруд носит характер второго по старости рукотворным сооружением Калининграда, сохранившимся до наших пор. Вплоть до начала XX века Верхний пруд чуть ли не до последней капли располагался за пределами города. Кольцо городских оборонительных сооружений проходило вдоль южного берега пруда (сейчас ул. Черняховского). В начале XX века старые оборонительные сооружения утратили военное значение, были выкуплены городом и частично снесены. Город стал расти за пределы старых границ. Рядом с озером был построен новый престижный район вилл Марауненхоф (район улицы Тельмана). Само озеро превратилось в место отдыха горожан. На берегах располагались купальни, кафе, рестораны, причалы для прогулочных лодок.
Берега озера украшены скульптурами памятниками. На западном берегу в 1913 году установлена группа из четырёх скульптур морских животных: моржа, морского слона, морской собаки и морского льва работы скульптора Германа Тиле. До наших дней сохранилось только две скульптуры, однако во время масштабных работ по очистке пруда и строительству набережной все скульптуры восстановили.