В 2000 году в зоне боевых действий, развернувшихся на территории республики Пенамстан, разбился вертолет, принадлежащий силам специального назначения США. Военный отряд, находившийся неподалеку, отказался подчиняться приказам командного центра и отправился на выручку экипажу. Однако они опоздали: все спецназовцы с вертолета были мертвы. Военным пришлось спасаться бегством, чтобы самим сохранить жизнь, однако капитан Джейсон успел заметить, что тело одного из погибших странным образом двигается... Спустя 6 лет Леон Кеннеди получил звонок из Белого дома: кто-то пытался взломать систему и завладеть секретным правительственным файлом. Вместе с тремя другими агентами, в числе которых оказался ветеран Пенамстана Джейсон, он отправился в резиденцию президента США, чтобы расследовать случившееся. Однако в темных коридорах Белого дома агентов поджидало нечто неожиданное — орда зомби... В это же время в Пенамстане внимание Клэр Рэдфилд привлекает странный рисунок местного мальчика, на котором изображен человек, зараженный вирусом. Клэр начинает собственное расследование, в ходе которого ее пути пересекутся с Леоном — вместе старые друзья выяснят правду о том, что же происходит на самом деле.