Контроль за влажностью воздуха в инкубаторе также очень важен. При низкой влажности яйца сильно теряют массу. Размер воздушной камеры увеличен. Особенно неприятна пониженная влажность воздуха в первой половине инкубации.
При недостатке влажности проклёв скорлупы и вывод молодняка ранние, молодняк мелкий и сухой. Скорлупа сухая и ломкая, с плотными подскорлупными оболочками. Наблюдаются случаи, когда, разломав скорлупу почти по всему периметру яйца, цыпленок не может разорвать подскорлупную оболочку. Относительно высок процент "задохликов"(вполне сформировавшиеся птенцы, погибшие на последних стадиях развития).
При повышенной влажности в инкубаторе яйца мало теряют массу. Проклев скорлупы и вывод молодняка запаздывают. У выведенного молодняка оперение слипшееся, грязное. Иногда наступает гибель невылупившихся птенцов в момент проклева: они захлебываются в неиспользованных околоплодных жидкостях. Часть молодняка погибает в результате присыхания кожи и клюва к скорлупе на месте проклева.
Для развития эмбриона необходим свежий воздух. Яйцо на протяжении всего периода инкубации потребляет 3,8 л кислорода и выделяет 3,5 л углекислоты. Поэтому подача свежего воздуха в инкубатор и удаление отработанного очень важны.
В начале инкубации подача свежего воздуха ограничена. К концу инкубации интенсивность вентиляции наибольшая, так как эмбрионы уже большие и потребляют много кислорода. Кроме того, во вторую половину инкубации выделяется много биологического тепла, которое необходимо от них отвести. Вентиляция выполняет и эту функцию.
При нарушении газообмена в начальном периоде инкубации отмечается повышенное количество уродств, в более позднем — возникновение разнообразных дефектов, в том числе пороков сердца. Во второй половине инкубации часто отмечается неправильное положение эмбриона — головой к острому концу яйца. Здоровый нормальный птенец должен вылупляться без посторонней помощи. Вначале он наклевывает скорлупу в средней части яйца, затем расширяет площадь наклева и, наконец, упираясь ногами в острый конец яйца, разламывает скорлупу.