• Говоря об именах, автор «Бегущего в лабиринте» Джеймс Дэшнер назвал своих персонажей не случайно. Все они — отсылки к разным философам, ученым и просто известным историческим личностям. Например, Томас (Дилан ОʼБрайен) — это Томас Эдисон, Ньют (Томас Сэнгстер) — Исаак Ньютон, Галли (Уилл Поултер) — Галилео, Алби (Амл Амин) — Альберт Эйнштейн, Уинстон (Алекс Дж. Флорес) — Уинстон Черчилль. Ну, а Тереза (Кая Скоделарио) — сама Мать Тереза.
• Не обошлось и без трибьюта съемочной группе. В первой части «Бегущего в лабиринте» на стене около входа в лабиринт, на которую герои наносят имена погибших, можно найти упоминания Вика Годфри и Уэса Болла — продюсера и режиссера «Бегущего» соответственно. Их же можно заметить и в финале «Лекарства от здоровья», но уже высеченные на мемориальном камне. Скорее всего, там же нацарапаны имена и других знакомых/друзей, причастных к съемкам фильма.
• В первой части «Бегущего в лабиринте» главный герой Томас, гуляя по лесу Глэйда, случайно натыкается на заброшенную могилу с надписью «Джордж». Во втором же фильме «Испытание огнем» Брэнда (напарница Хорхе) как-то говорит, что в детстве у нее был брат, с которым она проходила тесты П.О.Р.О.К. и которого также звали Джордж. Вероятно, это один и тот же человек, и один из первых подростков, попавших в Глэйд еще задолго до Томаса.
• У Джеймса Дэшнера, создателя вселенной «Бегущего в лабиринте», есть небольшое камео в финале первой части. Писателя можно мельком заметить на совещании членов П.О.Р.О.К., сидящим справа от Авы Пэйдж — главой организации.
• Здание, где Хорхе устроил логово со своими приспешниками в «Испытании огнем», может показаться знакомым. Похожая локация появляется в «Мстителях», четвертой части «Терминатора» или же сериале «Во все тяжкие». Дело в том, что съемки всех вышеперечисленных проектов частично проходили в Albuquerque Studios, неподалеку от которой можно встретить полуразрушенную конструкцию, часто используемую в фильмах и сериалах. Дизайн же и оформление многих построек в «Бегущем» были вдохновлены городом-крепостью Коулун — одним из самых кошмарных поселений Гонконга, известном густонаселенностью и беззаконием, и снесенном в середине 1990 годов.
• Самая главная же пасхалка появилась еще в «Испытании огнем», получив развитие в «Лекарстве от смерти». Когда Томас попадает на вечеринку к Маркусу, то начинает бредить от принятого наркотика, а затем ему мерещится Ньют в образе шиза. В третьей же части в логове Лоренса можно заметить мертвого тритона (англ. newt) в банке, а перед этим герои проходят через тоннель, где Ньют произносит фразу: «Если бы я был шизом, то спрятался именно здесь». Все это — намек на предстоящую смерть Ньюта и, пожалуй, один из главных переломных моментов вселенной «Бегущего в лабиринте».