На корабле с Шепардом связывается советник Валерн (если в первой части Совет спасен) или другой советник от саларианцев (если Совет погиб). Он говорит, что ситуация с "Кровавой стаей" критическая: биологическая лаборатория на Сур-Кеше находится в осаде и постоянно подвергается нападению наемников. Необходимо срочно встретиться со связным и разработать план действий.
Прибыв вдали от места боевых действий, капитан встречает старого знакомого - Киррахе (если он выжил на Вермайре) или саларианского офицера (если Киррахе погиб). Он сообщает, что "Кровавая стая" собирается захватить лабораторию и технологию для производства лекарства от генофага. Также он сообщает, что исследованиями руководит один из ведущих ученых. Если Мордин пережил самоубийственную миссию, это будет он, если нет - его заменит Падок Викс.
При встрече ученый скажет о цели проекта (возможности излечить генофаг, если кроганами правит Рекс, или работой над новым штаммом, если Рекс погиб). Однако, во время разговора на лаборатоию снова нападает "Кровавая стая" и приходится отбиваться, чтобы дать возможность ученым скопировать данные, забрать образцы и эвакуироваться (если Мелон убит во второй части, вариант с излечением невозможен).
Всего будет три волны: в первой будут ворка и варрены, во второй - ворка и кроганы-берсерки, в третьей - только кроганы, включая нескольких штурмовиков.
Отбив все три волны, отряд эвакуирует ученых и отправляется на корабль, чтобы окончательно решить проблему кроганов.