Мбаппе начал заниматься футболом в «ФК Бонди» — клубе, где его папа работал тренером. Юный Килиан выделялся на фоне сверстников, и один из тренеров академии Антонио Риккарди сказал, что тогдашний 6-летний Мбаппе был лучшим воспитанником, которого он тренировал за 15 лет.
После «AS Bondy» игрок перешёл в лучшую академию Франции – «Клерфонтен», воспитанниками которой были такие звёзды мирового футбола, как Тьерри Анри и Лилиан Тюрам. В 13 лет Килианом начинают активно интересоваться гранды мирового футбола: «Челси», «Бавария», «Реал Мадрид» и «Манчестер Сити». Зинедин Зидан, работающий на тот момент с молодёжкой «Реала», пригласил Мбаппе в Мадрид, но посовещавшись с отцом, подросток решил отказаться от поездки.
Также Килиан ездил в Западный Лондон, где его встречали тренер «Челси» Карло Анчелотти и главный нападающий команды Дидье Дрогба, однако юный футболист предпочёл остаться ближе к дому, выбрав «Монако». Мбаппе присоединился к молодёжной академии «монегасков» в 2013 году, а через два года, в возрасте 16 лет, он дебютировал за основную команду клуба.
Карьера в ФК Монако
Мбаппе дебютировал за первую команду «Монако» 2 декабря 2015 года в матче Лиги 1 против «Кана», заменив Фабио Коэнтрао на 88-й минуте.
20 февраля 2016 года Килиан забил первый гол за команду в домашнем поединке Лиги 1 против «Труа», став самым молодым автором гола в истории «Монако». 6 марта 2016 года руководство «монегасков» и родители футболиста провели встречу, по результатам которой Мбаппе подписал свой первый профессиональный контракт, по которому стал зарабатывать € 80 в месяц.
Сезон 2016-2017
В сезоне 15/16 юный нападающий хорошо себя проявил, и уже в следующем сезоне главный тренер «Монако» Леонарду Жардим включил игрока в число основных состава.
Мбаппе не переставал удивлять своей игрой, и 14 декабря 2016 года в рамках Кубка Франции он отметился первым хет-триком, а уже 11 февраля 2017 года талантливый форвард записал на свой счёт хет-трик в рамках чемпионата Франции.
В целом сезон 16/17 выдался очень удачным для Мбаппе. Во всех турнирах он сыграл 44 матча и забил 26 мячей. Вместе с «Монако» футболист выиграл золотые медали Лиги 1.
Что касается Лиги Чемпионов УЕФА, то в этом турнире Килиан Мбаппе сверкал не менее ярко, чем во внутреннем чемпионате. «Монако» сенсационно добрался до полуфинала ЛЧ, обыграв в плей-офф «Манчестер Сити» и «Боруссию Дортмунд». На стадии полуфинала «монегаски» встречались с туринским «Ювентусом». По итогам двух встреч счёт был 4:1 в пользу «бьянконери». Несмотря на то, что «Монако» сумел одолеть «Старую Синьору», Мбаппе сумел забить голкиперу этой команды легендарному Джанлуиджи Буффону, сухая серия которого на тот момент составляла 600 минут.
Карьера в ФК Пари Сен-Жермен
Летом 2017 года «ПСЖ» предпринял все попытки, чтобы заполучить мега талантливого форварда «Монако». Сторонам удалось договориться об аренде на целый сезон, а уже летом 2018 парижане выкупили права на Мбаппе за 145 + 35 млн. евро бонуса.
Сезон 2017-2018 получился удачным для футболиста. Неймар, Мбаппе и Кавани сформировали одно из сильнейших атакующих трио в Европе, которое выглядело мега результативным. По итогам сезона Килиан выиграл с командой Лигу 1, Кубок Франции и Кубок Французской лиги. В Лиге Чемпионов «ПСЖ» прекратил выступления на стадии 1/8 финала, проиграв по итогам двух матчей мадридскому «Реалу». Во всех турнирах сезона 17/18 юный нападающий отыграл 44 матча, в которых отличился 21-м забитым мячом.
В июле 2018 года Мбаппе взял себе футболку с номером 7, который освободился от Лукаса Моуры.
Во втором сезоне за «ПСЖ» Мбаппе помог команде выиграть чемпионат, но в Лиге Чемпионов, команда сошла с дистанции на стадии 1/8 финала. В Лиге 1 Килиан стал лучшим бомбардиром и до сегодняшнего дня он продолжает удивлять весь мир своей игрой.