Возводя Кондуйский дворцовый комплекс, потомки Чингисхана считали, что земля за Байкалом навечно принадлежит им и никто не посмеет посягнуть на неё, но минули века, Монгольская империя была разодрана на куски и поглощена своими более зубастыми соседями, а в Забайкалье прочно обосновались когда-то завоёванные монголами русские, которые видели в сожжённом к тому времени Кондуйском дворце всего лишь источник стройматериалов для своих нужд, в том числе и для строительства церкви, вошедшей в списки объектов культурного наследия России федерального значения.
Храм Казанской иконы Божьей Матери в Кондуе был заложен в 1803 году на средства благочестивой вдовы Марии Семёновны Эповой в память о её муже, казачьем уряднике Семёне Эпове, погибшем в бою с китайскими контрабандистами. Со строительным материалом кондуйцы не заморачивались, взяв его с никому не нужных развалин Кондуйского дворцового комплекса, на что они имели полное право, ведь в XIII веке Кондуйский дворец для племянника Чингисхана Исунке строили в числе многих и русские рабы, пригнанные из Владимиро-Суздальского княжества, а в 1773 году село Кондуй основали выходцы из Владимирской губернии.
Храм, освящённый в 1806 году в честь Казанской иконы Божьей Матери и святых мучеников Кирика и Иулитты (придел), получился на славу. Помимо того, что достойным элементом внешнего декора храма были элементы отделки Кондуйского дворца, внутри он тоже был прекрасен (по свидетельству прихожан, заставших кондуйский храм до его окончательного закрытия, внутри его всё сияло золотом, в нём было много ценных икон и книг, но любителям позубоскалить можно ответить, что при храме Казанской иконы Божьей Матери в Кондуе действовали четырехклассное училище с ремёсленными мастерскими, амбулатория и больница). Всё это великолепие было разгромлено пришлыми коммунарами в 1929 году во время коллективизации, хотя смысла в этом не было, ведь кондуйцы еще в 1921 году абсолютно добровольно объединились в коммуну "Красные всходы", а настоятель храма Лука Эпов (к слову, бывший полковым священником в красном партизанском отряде) активно поддерживал это начинание и духовно, и материально. После погрома 1929 года храм использовался как зернохранилище, а после распада СССР был заброшен. В настоящее время уже готов проект реставрации храма Казанской иконы Божьей Матери в Кондуе, признанного объектом культурного наследия федерального значения, но на его реализацию ни у жителей села Кондуй, ни у Нерчинской епархии, к которой относится кондуйский храм, нет средств, остаётся надеятся только на посильные пожертвования.