Данные по Y хромосоме можно разделить на 2 категории. Полученные из научных проектов и в коммерческих лабораториях. Первый тип хоть и бесплатен, но абсолютно не прозрачен и не подлежит анализы в генеологических целях, почти всегда. Речь в данной публикации пойдет о коммерческих тестах, которые может приобрести каждый желающий.
FTDNA - Family Tree DNA. Американская компания базирующаяся в Хьюстоне. Мировой лидер по количеству тестов. Предоставляет услуги как по аутосомным тестам так и по митохондриальным и Y хромосомным тестам. На сайте FTDNA можно найти тысячи ДНК проектов как открытых так и закрытых. Каждый такой проект содержит базу гаплотипов. При этой сайт не предоставляет серъезных аналитических инструментов. Обычным людям приходится полностью полагаться на администраторов проектов, многие из которых уже не так активны в своей деятельности.
Главное конкурентной преимущество FTDNA это их большая база STR гаплотипов. Без возможности сравнения с какой-то базой набор маркеров не несет особой полезной нагрузки. При этом, имея большую базу FTDNA не предоставляет серьезных аналитических инструментов. Встроенный инструмент поиска STR совпадений очень скудный и рассчитан, в основном, на западную аудиторию с наличием значительного числа совпадений.
Система дает выбрать уровень сравнения (12 - 25 - 37 - 67 - 111 маркеров).
Ссылка на описание результатов
На уровне каждом из уровней показываются совпадения до порогового значения генетической дистанции.
- Y12 - 1
- Y25 - 2
- Y37 - 4
- Y67 - 7
- Y111 - 10
Все что на один шаг выше не показываются. Также не видно по каким конкретно маркерам отличаются результаты. Данный функционал предоставляют сторонние сервисы, о которых мы поговорим в других публикациях.
Полезный инструмент - Гаплодрево FTDNA.
YSEQ - Немецкая компания созданная бывшим сотрудником FTDNA, известным специалистом в этой области Томасом Краном. Главное преимущество YSEQ - более низкая стоимость услуг и более гибкий подход. В частности самый базовый набор маркеров YSEQ alpha содержи 18 маркеров, вместо 12 от FTDNA. При этом еще и цена ниже, 58$ против 70$.
Несомненный плюс YSEQ в том, что вам не обязательно заказывать у них наборы для тестирования. Вы можете приобрести щетки локально (примерно 15-50 руб. за пару щеток) и отправить в Германию. Это значительно ускоряет процедуру.
Другой важный плюс YSEQ это SNP и точечные маркерные тесты. YSEQ дает возможность протестировать любой выбранный вами SNP за 18$. Даже если этот SNP выявлен только у вас и больше ни у кого пока нет. Стоимость единичных маркерных тестов начинается с 11$.
Кроме того, YSEQ предоставляет услуги полногеномного секвенирования. Есть целая линейка продуктов, самая доступная из которых WGS400 стоимостью 400$. За эти 400$ вы получаете всю линейку продуктов FTDNA да еще и с лучшим качеством. Полученные результаты в целях качественной интерпретации необходимо загрузить на сайт Yfull (45$). Аутосомные результаты можно загрузить на многие сайты. Об это мы поговорим в отдельной публикации.
Nebula genomics - Американская компания которая предоставляет полный геном за 290$. Само секвенирование осуществляется в Китае на современных секвенаторах DNBSEQ-T7. Время готовности 2 месяца с момента получения образца в лабораторию. Однако в последние месяцы наблюдается задержка. К качеству самого теста претензий нет. Результы также можно загрузить на Yfull и итд.
Никакой базы STR (и такой услуги в принципе) и гаплодрева у компании нет. Фактически вся ценность данных по Y хромосоме без Yfull ничего не стоит. После загрузки на сайт Yfull вам предоставят лучший на рынке анализ, включая все SNP и большую часть маркеров.
Dante labs - Итальянская лаборатория по секвенирования ДНК. Предоставляет услуги по полногеномному секвенированию ДНК. Стоимость в обычный период значительно превышает цены конкурентов. Имеет смысл покупать в период осенних распродаж, чаще всего это черная пятница (конец ноября). В указанный период цена опускается до 150-170 $. Это безусловно лучшая цена на рынке из всех возможных вариантов. Однако минусы есть и тут. Главный из них это неоднозначная репутация. Много жалоб на медлительность итд. Были претензии к качеству теста. По последней информации большая часть проблем решена. Еще один минус это необходимость самостоятельной (либо платной) сборки генома. Процедура не такая сложная, но требует наличия определенных навыков. Обработанные данные можно загрузить на любые сайты которые позволяют загружать подобные данные (Yfull итд.)
Отдельно можно выделить компании которые специализируются на аутосомных тестах. Самые известные из них 23andme, Ancestry и Myheritage. Эти компании не отправляют в РФ свои наборы. Однако используя различные посреднические сервисы их заказать в РФ можно. Однако они в большей степени нацелены на западный рынок. База совпадений которая у них есть для РФ не так актуальна. Стоимость таких тестов от 50 до 100$. В сравнении с аутосомным тестов от FTDNA у них есть существенный плюс. FTDNA вырезает из итоговых данных все что касается митохондриальной ДНК и Y хромосомы. В то время как у вышеназванных компаний по аутосомам возможно определить гаплогруппу. Хотя в любом случае отдельный Y тест или полногеномный тест намного предпочтительнее.
Если по каким либо причинам вы не готовы отправлять свои данные за границу, то услуги по секвенированию ДНК предоставляют и Российские компании. 2 основные это Genotek и Atlas. Однако цены на их услуги значительно выше. В несколько раз. К примеру полногеномный тест Атлас стоит 94500 руб., что почти в 4 раза больше стоимость услуг Nebula.
В какую лаборатории обратиться каждый в итоге решает сам, однако рекомендуется в первую очередь полногеномные тесты. Такие тесты содержат полный набор данных и лишены многих недостатков устаревших технологий. Если вопрос надежности для вас на первом месте, лучший выбор YSEQ. Если цена в приоритете, тогда стоит дождаться ноябрьских скидок в Dante Labs, уж очень выгодные у них цены в этот период.