Группа названа в честь американской футбольной команды (американский футбол) San Francisco 49ers. Cобрал группу Джанфранко Бортолотти, подключив к проекту Луку Читтадини, Пьерадиса Россини и Диего Леони. Дебютный сингл "Die Walküre" 1988 года был основан на вокале из "I.O.U." британской группы Freeez и достиг 20-го места во французском чарте синглов. Годом позже последовал трек "Shadows".
Место фронтвумен коллектива тогда занимала Джози Джил Персия. В 1989 году продюсеры нанимают другую певицу, Доун Митчелл, а Персия переключилась на бэк-вокал.
В декабре 1989 года выходит их главный хит "Touch Me". После грандиозного международного успеха своих соотечественников Black Box c их "Ride On Time", Бортолотти и компания спешат сделать свой танцевальный шедевр. Они берут на вооружение тот же первоклассный итало-хаус - громкие ритмы, бодрящие фортепьяно, изобилие струнных и, запоминающееся пение. Роль Лолитты Холлоуэй в их треке исполнила Арета Франклин.
А капеллу Ареты Франклин продюсеры взяли из её песни "Rock-a-Lott", а припев соорудили, взяв вокал Алишы Уоррен, у неё как раз в том году вышел хаус-сингл "Touch Me". Митчелл оставалось только открывать рот, синхронизируя пение. Запоёт она на следующих синглах.
Песня "Touch Me", выпущенная 49ers, стала успешной по всему миру и попала на первое место в Биллборд, в танцевальный чарт. В Европе сингл вошел в десятку лучших в Австрии, Дании, Финляндии, Франции, Германии, Греции, Ирландии, Испании, Швеции, Швейцарии и Великобритании, в 20-ке лучших - оказался в Бельгии, Нидерландах, Австралии и Новой Зеландии.
Следом выходит "Don't You Love Me", которая также стала № 1 в Billboard Hot Dance Club Play, а так же 78-е место в Billboard Hot 100. В европейских чартах трек занял 12-е место в Великобритании и 10-е место в Швейцарии и номер 6 - в Ирландии. В сингл вошли вокальные сэмплы из хита Джоди Уотли 1987 года "Don't You Want Me ".
"Girl To Girl" - этот сингл мог похвастаться 13-м местом в Ирландии, 20-м в Швейцарии, 36-м в Великобритании и 70-м в Германии.
Все эти песни вошли в дебютный альбом проекта, вышедший в 1990-м и названный просто - "49ers" (японское издание носило название "Touch Me"). На следующий год выходит два альбома ремиксов с песнями этого альбома. И в том же году группу покидает Митчелл.
Джанфранко Бортолотти начинает поиски новой певицы для 49ers. Но из прослушанных кандидатов никто не понравился, искали певицу, чей голос был бы идеально подходящим. Бортолотти посоветовали послушать певицу из Лондона Анн-Мари Смит, певшую в New Life и уже снискавшую в Англии славу "лучшей певицы стиля гараж". Услышав демо-запись её голоса Бортолотти понял, что поиски окончены. Сразу после этого Анн-Мари приезжает в Италию и начинает работать над новым альбомом 49ers.
Оперативно были выпущены два успешных сингла "Move Your Feet" и "Got To Be Free". Вторая песня была хитом прошлого коллектива Анн-Мари "New Life". Далее она записала вокал для "The Music Is Movin' ", выпущенного Марио Фарджеттой. Это был хит лета 1992 года.
Осенью 1992 года у 49ers выходит второй альбом "Playing With My Heart" и новый сингл "The Message". Затем Анн-Мари снова записывается с Фарджеттой. На этот раз была перепета классика британского рок-музыканта Джона Майлза "Music".
В феврале 1993 года новый сингл 49ers "Everything" стал очень популярным на радио и в клубах. А летом группа записывает второй хит прежнего коллектива Анн-Мари New Life, "Keep Your Love" и получает очень хорошие отзывы публики по всей Европе. В октябре 1994 года сингл "Rocking My Body" так же последовал по пути успеха. В Великобритании он стал 31-м.
В марте 1997 года был выпущен альбом "Baby, I'm Yours" , за которым последовал еще один сингл под названием "I Got The Music" .
После выпуска сингла "Let The Sun Shine In", на который возлагались большие надежды, но он прошёл мимо чартов, о 49ers какое-то время совершенно ничего не слышно. Команда Media Records, возглавляемая Бортолотти была занята другими проектами. Только в 2002 году 49ers выпускают новый сингл "My Heart", чтобы снова пропасть почти на 10 лет. Они вернулись в сентябре 2010 года с синглом "Je Cherche Apres Titine". В нём использован голос Чарли Чаплина, певшего эту песенку в фильме "Новое время", а сам трек напоминал электро/ретро "We No Speak Americano" от Yolanda Be Cool & DCUP.
2013 год: вышел новый сингл 49ers под названием "Shine on in love" с участием Шерил Портер.