Найти в Дзене
YSEQ.ru

Yfull - лучшее древо гаплогрупп Y-хромосомы человека

В предыдущей публикации мы рассмотрели отличии Y-STR и SNP тестов. Для определения всех SNP Y хромосомы необходимо полное ее секвенирование. Только после этого вы сможете загрузить ваши результаты на гаплодрево Yfull.

Что такое гаплодрево?

Когда вы получаете результаты своего теста у вас сразу возникает вопрос, а что с этими данными делать? Необходима база с которой вы сравниваетесь. В настоящий момент существуют 2 самых популярных гаплодрева, FTDNA и Yfull. Yfull компания которая занимается профессиональной интерпретацией данных ДНК тестов. Сами они тесты не делают. С другой стороны FTNDA, все еще крупнейшая компания с самой большой базой Y хромосомных тестов. FTDNA не позволяет другим компаниям размещать свои тесты на их гаплодреве. В то время как Yfull универсальное место, единая база для всех лабораторий мира.

Дополнительное преимущество Yfull в том, что они загружают на свое древо и древние образцы, если они соответствуют определенным критериям качества.

Но ключевое преимущество Yfull Ytree в том, что это единственная компания которая рассчитывает TMRCA (время до ближайшего общего предка).

Начнем по порядку

Разберем интерфейс сайта

Ссылка на древо

Yfull регулярно обновляют свое древо на основе новых данных. На скриншоте выделена версия v9.01.00. Сайт позволяет открыть и архивные версии, если вам это понадобиться.

Ниже представлены гаплогруппы и их подветки. Древо содержит около 100 тысяч образцов. При нажатии на любую группу будет доступна дальнейшая детализация.

Вот пример как выглядит древо гаплогруппы J2

-2

На самом верху детализируются уровне. Если на предыдущем скриншоте только надпись Home присутствовала, то здесь уже выделяются более глубокие уровни. Так J2 входит в J, та в свою очередь в IJ итд. Все эти названия кликабельны, можно перемещаться по уровнят.

Древо расходится на разные уровни. Многим тяжело разобраться во всех этих линиях, уровнях, подуровнях. На уровне целой гаплогруппы это и не требуется. Для того чтобы разобраться в связи внутренних уровней удобно использовать другой вид - Диаграмма.

Откроем для примера внутренний уровень более глубокий

-3

На картинке отображается гаплогруппа (Гг) J-Z42957. Возраст образования это Гг 11400 лет. TMRCA - 10500 лет. Т.е. Все образцы которые идут ниже верхней стройки J-Z42957 имеют одного предка, который жил ориентировочно 10500 лет назад. Цифра очень большая и назвать их родственниками конечно нельзя, но внутри есть более близкие между собой.

Тот же уровень J-Z42957 в формате Диаграммы

-4

Обратите внимание на Иракский флаг на самом верху. Многие не понимают почему так происходит, создается впечатление, что все кто ниже произошел от тех кто выше. Это конечно не так, все люди одинаково древние. Причина по которой этот человек (из Ирака) остался на верху только в том, что у него не нашлось близких совпадений. Этот человек одинаково "близок" всем нижним уровням. TMRCA 10500 лет. Т.е. ему из всей базы Yfull "ближе" всего те что идут ниже. Но они на расстоянии 10500 лет. А все другие еще дальше.

Если спустимся на один шаг ниже, то увидим Саудовский флаг. У него TMRCA 7200 лет. У него есть SNP которых не было у человека из Ирака и которые есть у всех кто ниже.

Другой пример на картинке это Катарцы. Их ветка отделилась от другой, где Украинцы, Литовцы, Венгры, Россияне, Румыны 5300 лет назад. Как это определяется? Смотрим на верхний уровень, который общий и для Катарцев и Европейцев. TMRCA 5300 лет. Formed 7200 лет. Их общие предки отделились 7200 лет назад, но их последний общий предок жил 5300 лет. На нижнем уровне все тоже самое. Formed нижнего уровня совпадает с TMRCA верхнего. Т.е. Катарцы и Европейцы имели общего предка 5300 лет назад. Но TMRCA самих Катарцев всего 300 лет. Т.е. это относительно близкие родственник.

Древо Yfull очень удобный инструмент для анализа далеко и не очень далеко прошлого своих предков. TMRCA помогает определить реальную картину, отделяя близкородственных от далеких. К примеру вы можете протестировать 20 своих близких родственник, загрузить на древо и выставить флаг Зимбабве. Для непосвященных картина вашей ветки будет выглядеть так, как будто все произошли от Зимбабвийцев. Но достаточно посмотреть на TMRCA и все будет очевидно. На практике такое часто случается с Арабами. Они очень часто тестируют многих своих родственников и их становится очень много на древе. Но общий предок у них, как правило, жил не так давно.

Как тогда определить где мог жить ваш далекий предок? Один из самых адекватных способов, это анализ того, какую страну представляет тот или иной результат с учетом TMRCA. Но смотреть надо и вышестоящие ветки. Для этого в строке сайта Yfull где перечисляются название веток нужно передвигать назад и смотреть там. Не всегда можно уловить закономерность, но часто это помогает. Например если почти на каждом уровне встречаются Германцы, то можно сделать вывод, что предки могли быть с ними связаны. Но стоит учитывать и TMRCA.

В дальнейших публикациях мы продолжим знакомство с особенностями древа Yfull. Пока рекомендуем открыть это древо и попробовать разобраться.