Построен в 1591-1593 годах в честь Донской иконы Божией Матери. Выполнен в стиле одноглавой храмовой русской архитектуры XVI века.
считается первым по времени возведения зданием обители. Особенность Малого собора в том, что он совсем не похож на монастырские соборные храмы того времени.
В XX веке были уничтожены переделки, и собор открыл уникальные росписи 1780-х годов работы итальянского мастера Клаудио.
В 1930 году собор был закрыт,
но в 1946 году возобновились богослужения и мироварение.
Мироварная печь действует здесь до сих пор.
Раз в год на Страстной (последней) седмице Великого Поста в Малом соборе Донского монастыря варят из чистого оливкового масла с добавлением белого вина и различных благовоний миро, которое освящают в Великий Четверг за богослужением в Богоявленском кафедральном соборе.