Да, по большому счету "банкнота" и "купюра" это одно и тоже. Однако если изучить вопрос глубже, то вы видим что банкнотой называют бумажный денежный знак, который выпускается Государственным банком, для повседневных расчетов. Стоимость банкноты гарантированно обеспечивается золотым запасом государства.
Купюрой может быть любая ценная бумага, как бумажные деньги (банкноты) так и акции, аблигации или сертификаты, которые не находятся в постоянном обороте и не используются для расчетов в розничной торговле.
Получается что Купюра это более общее понятие, и понятие Банкнота подчинительно ей, а точнее входит в это понятие.
В обиходе, бумажные денежные знаки называют "купюрами" - так и привычнее и удобопроизносимее. На профессиональном языке финансистов, бумажные деньги называют "банкнотами")