До сих пор существуют две теории происхождения этих животных. Согласно первой монофилетической, эти животные имеют в своём роду одного лишь предка. Долгое время считалось, что прародителем современного пса является серый волк, ведь недаром многие породы домашнего животного схожи по внешнему виду с этим хищником.
Однако последние несколько лет эта теория успешно опровергалась. Центральные доводы таковы:
молекулярный анализ ДНК останков древних собак и волков указывает на большую разобщённость в генетики между этими животными; черепа этих зверей, найденные во время раскопок, не похожи друг на друга; все проведённые опыты по скрещиванию этих двух животных не дали необходимого результата. Выведенные экземпляры продолжали оставаться агрессивными; опыты по одомашниванию волка до сих пор оканчивались неудачно. Оказалось невозможным победить природную осторожность хищника; физиологические особенности волка превосходят собачьи.
Большинство учёных придерживается мнения, что собака происходит от шакалов. Именно они, а не волки, могут подойти к селениям, где живут люди, а в трудные времена питаться отходами в отличие от серых хищников, которые от голода готовы напасть на жертву, а не подбирать еду.