Бассейн реки Пехорки был освоен славянскими народами издавна. Первые поселения вятичей и кривичей появились здесь ещё в первом тысячелетии, во время освоения ими московского края. Наибольший интерес для историков представляет комплекс археологических памятников у села Акатово (ныне в черте микрорайона Салтыковка), который и является наиболее ранним свидетельством жизни славян в нашем городе.
В XVII-XVIII веках при реке Пехорке возникла новая система прудов, которая четко зафиксирована на плане Московского уезда по Генеральному плану межевания 1794 года. Пруды возникли, скорее всего, в ходе строительства новых фабрик, которым требовалось много воды. Так появились дамбы и плотины в Пехра-Покровском, Блошихе, Леонове, Акатове. Именно тогда в северной части Пехорки был создан Маланьин пруд, который прекрасно виден с Щёлковского шоссе. Примерно в то же время при балашихинской фабрике возник свой пруд шириною около 150 метров. А чуть южнее, у сельца Сусаново–Гущинка (в районе нынешнего городского парка культуры и отдыха), был образован еще один водный бассейн длиной 800 м и шириной 130 метров. Все эти рукотворные водоёмы сегодня стали излюбленным местом отдыха балашихинцев.
В XVIII-XIX веках многие поселения, входящие ныне в состав Балашихи, получили всероссийскую известность. В Пехра-Яковлевском жили князья Голицыны, под Пехра-Покровским, в Алексеевском дворце, часто проводил свободное время сиятельный князь генералиссимус А.Д. Меншиков, а в Троицком-Кайнарджи недолго жил другой российский герой – генерал–фельдмаршал П.А. Румянцев-Задунайский.
Впоследствии именно вокруг реки образовалась Пехорская волость, ставшая прообразом Балашихинского района. В соответствии со справочной книгой исправника Московского уезда Афанасьева, в 1834 году в Пехорской волости было 28 сёл, деревень, слобод и местечек, где жили примерно 10 тыс. человек. Впоследствии из 45 фабрик Московского уезда 15 располагались именно в Пехорской волости и на них работали порядка 6 тысяч человек.
Если в целом говорить о бассейне реки Пехорки, то это довольно обширная единая территория, простирающаяся с севера на юг на 40 километров, а с запада на восток – на 20 километров. Длина реки – 42 км.
Пехорка впадает в Москву-реку в районе города Жуковского, в 4 километрах к югу от железнодорожной станции Быково.