Зачем то производители Астры Линукс усложнили первоначальную настройку времени, и каждый экземпляр системы как я понимаю может работать сервером времени для других.
У меня проблемы со временем на машинах были связаны с тем что на шлюзе время идёт не правильно и Астра Линукс с него почему то брала время, и все попытки настроить время вручную откатывались в ошибочное время. А проблема решалась просто:
sudo apt purge ntp - удаляем не нужный сервер времени, на вопрос отвечаем Y
настраиваем клиент:
sudo timedatectl set-ntp true
sudo systemctl start systemd-timesyncd
Проверка результата:
sudo systemctl status systemd-timesyncd
Всё просто, если знать где искать.
Подробная инструкция есть на сайте ОС https://wiki.astralinux.ru/pages/viewpage.action?pageId=27361687