Будущий актер родился накануне Нового 1939 года в нью-йоркском городе Йонкерс.
Папа Джонатана зарабатывал тем, что учил богачей играть в гольф. Он был примерным католиком и старался привить веру трем своим сыновьям
Впоследствии старший брат актера Барри станет вулканологом и будет работать в Пенсильванском университете, а младший Уэсли начнет писать музыку и прославится в качестве композитора.
В ранней биографии Джона Войта есть период учебы в архиепископской школе в городке Уайт Плейнс, где он участвовал в комических постановках самодеятельного театра.
В 1956 году парень стал студентом католического университета в Вашингтоне, где изучал изящные искусства. Через четыре года он начал учиться в школе-студии «Neighborhood Playhouse» в Нью-Йорке.В молодости начинающий актер снимался в сериалах.
Его можно было увидеть в «Защитниках», «Вертикальном взлете», «Обнаженном городе» и «Дымке со ствола» в эпизодических ролях. В 1965 году Джон начал играть в бродвейском спектакле «Вид с моста». Пьесу написал знаменитый американский драматург Артур Миллер.В 1967 году он получил премию «Театр Мира» за роль в спектакле «Этим летом в этом сезоне».
Первого главного героя в своей кинематографической биографии Войт сыграл в 1967 году в пародийном «Бесстрашном Фрэнке». Тогда же он появился в эпизоде в приключенческом «Часе оружия».
Но прославил молодого актера простодушный жиголо из Техаса Джо Бак, которого Войт в 1969 году сыграл в потрясном «Полуночном ковбое». В этой драматической ленте рассказывается о парне, приехавшем в Нью-Йорк за лучшей жизнью. В большом городе он встретил мелкого воришку-туберкулезника Ратсо Риццо, которого в фильме можно увидеть в блестящем исполнении Дастина Хоффмана.
Молодые люди подружились и начали заботиться друг о друге. Картина вышла на экраны кинотеатров с категорией 17+. Драма стала обладателем трех «Оскаров», но игру Войта своей премией отметили только кинокритики Нью-Йорка. Кроме того, за исполнение роли Джо Бака Джона номинировали на «Оскар», наградили «Золотым глобусом» и премией BAFTA в категории «Самый перспективный дебютант».
