1 февраля 2009 года митрополит Смоленский и Калининградский Кирилл был интронизирован 16 патриархом Московским и всея Руси. Понтификат с самого начала не задался и проходил в режиме постоянных скандалов и потери авторитета церкви в обществе.
Среди скандалов ярких скандалов можно вспомнить:
1. Скандал с выступлением в храме Христа Спасителя группы Пусси Райт в 2012 году. Поддержал уголовный срок для активисток данной группы, чем вызвал резонанс в обществе.
2. Поддержал власть и осудил протестующих против результатов избирательной компании 2011-2012гг.
3. В июле 2013 года возглавил богослужение в честь 1025 лет крещения Руси в Киеве, но в феврале 2014 года после евромайданных событий и свержения Януковича фактически стал персоной нон-грата и после этих событий и больше не посещал этой страны. Украинская тематика с этого времени станет главной проблемой его патриаршевства.
4. В 2016 году отказался ехать вместе с патриархами Болгарии, Антиохии и Грузии на критский всеправославный собор, организованный патриархом Варфоломеем. Варфоломей воспринял это в качестве оскорбления, и готовил удар по украинскому "флангу" РПЦ.
5. В 2018 году патриарх Кирилл разрывает все отношения с константинопольским патриархом Варфоломеем из-за его решения признать раскольные УПЦ КП и УАПЦ, после объединительного собора под единой эгидой "Православная церковь в Украине".
6. В 2019 году патриарх Кирилл разрывает отношения с александрийским патриархом Федором II и архиепископом Афин и всея Эллады ИеронимомII из-за их решения признать украинскую ПЦУ.
7. В 2020 он разрывает отношения с кипрским архиепископом ХризостомомII по той же самой причине признания ПЦУ.
