История начинается с таинственного исчезновения частного детектива Гарри Гудмана, расследовать которое предстоит его 21-летнему сыну Тиму. Помощь в расследовании ему окажет бывший партнер отца, болтливый детектив Пикачу, который является загадкой даже для себя самого. Обнаружив, что они каким-то фантастическим образом способны общаться друг с другом, Тим и Пикачу отправляются за уликами по неоновым улицам Райм Сити – современного разросшегося мегаполиса, где люди и покемоны живут бок о бок. Парочка встречают самых разнообразных покемонов и раскрывают ужасный заговор, который способен разрушить это мирное сосуществование и стать угрозой для всей вселенной покемонов.
Детектив Гарри Гудман, который раскрыл множество запутанных преступлений и вернул близким не одного пропавшего человека, сам непостижимым образом исчез. Его поисками занимается сын Тим, а помощником парня выступает напарник отца – забавный и вместе с тем проницательный сыщик покемон Пикачу . Тим с удивлением узнает, что способен понимать это создание на подсознательном уровне.