Джон Марк Галэки родился в Бельгии в американской семье. Имеет польские, итальянские и ирландские корни.
В возрасте семи лет вышел на большую сцену очень известного театра в городе Чикаго. А уже в возрасте одиннадцати лет был номинирован на престижную театральную премию. В двенадцать лет Джонни дебютировал в кино, сыграв роль в фильме «Одна ночь из жизни Джимми Рирдона».
В 1989 году парень прошёл пробы на фильм «Рождественские каникулы». Следующая его работа была связана с телевидением, где он появился в сериале «Внезапная ярость».
В сериале «Розанна» Джонни сыграл свою самую известную подростковую роль. В 1994 году Джонни получил престижную премию Young Artist Award.
В 1997 году Джонни досталась маленькая роль в хите «Я знаю, что вы сделали прошлым летом». Затем последовали эпизодические роли в таких хитах как — «Мистер Бин», «Чужой билет», «Ванильное небо». А в комедийном триллере «Букмекеры», Джонни досталась главная роль.
В 2006—2007 годах Галэки играл роль в бродвейском спектакле «Маленькая собачка смеётся».
А в 2007 году Джонни начал сниматься в сериале, который сделал его настоящей звездой. В «Теории большого взрыва» . Первоначально ему предлагали роль Шелдона Купера, однако актёр сказал, что ему больше подходит роль Леонарда.
В 2008 году Галэки мелькнул в супергеройской комедии «Хэнкок», с Уиллом Смитом и Джейсоном Бейтманом. В июле 2011 года, он сыграл сам себя в трех эпизодах телесериала «Красавцы». В том же году он появился в фильме «Время» с Джастином Тимберлейком и Амандой Сейфрид.
Так же Галэки умеет играть на виолончели.
Во время съёмок в сериале «Теория большого взрыва» Галэки встречался с Кейли Куоко ( по сериалу "Пенни") на протяжении двух лет — аналогично тому, как их персонажи в сериале. Он и Кейли остались хорошими друзьями.
В 2012—2014 годах встречался с Келли Гарнер.
С сентября 2018 года Галэки официально встречается с Алайной Мейер. В декабря 2019 года у пары родился сын.