Игорь Лифанов за свою жизнь пережил три брака. Его первый брак с Еленой Павликовой был заключен, когда они учились в колледже, но вскоре после этого он распался. Его второй брак с актрисой Татьяной Аптикаевой продлился 13 лет. В 2003 году во время съемок в Севастополе он познакомился со студенткой Еленой Косенко, которая стала его третьей женой. На первый взгляд их брак казался идеальным, но позже выяснилось, что Елена была неверна.
В начале 2000-х Лифанов перевез Косенко из Севастополя в Санкт-Петербург. В то время ей был 21 год, а ему - 37. Он содержал два домашних хозяйства в течение длительного периода. В 2011 году Косенко забеременела, и актер развелся со своей второй женой и женился на ней. У них родилась дочь Элис.
Согласно сообщениям, несмотря на внешность, брак актера был омрачен неверностью со стороны его жены. Несмотря на это, он простил ее ради их дочери. Источник, близкий к актеру, заявил, что, хотя он пытается забыть об изменах, когда он трезв, они становятся для него источником сильной боли, когда он пьет. Актер верил, что обеспечивает своей жене стабильную жизнь, фамилию и будущее, но она изменяла ему с несколькими партнерами, даже с его крестником в соседней комнате.
Актер, однако, признал, что он тоже был не без вины, поскольку признался в измене с другой женщиной, будучи женатым на своей второй жене. Он критиковал мужчин, которые ведут двойную жизнь и обманывают своих партнеров. Он признал, что неверность - это форма предательства и что она может причинить огромную боль партнеру. Он также признал, что развод был трудным процессом для обеих сторон и что он не уверен в том, как ему удалось с этим справиться.