В Resident Evil 4 сюжет отображает события спустя шесть лет со дня заражения в Раккун-Сити. Кеннеди сейчас работает на правительство США. Осенью 2004 года его отправляют в Испанию с миссией найти Эшли Грэм – дочь президента, похищенную таинственной организацией Лос-Иллюминадос. Ему помогает Ингрид Ханниган – американский правительственный агент, дистанционно контролирующий шаги Леона. Добравшись до испанской деревни, рутинная миссия превращается в ад на земле. Параллельно с Леоном на месте появляется Ада Вонг, действующая от имени Альберта Вескера. Цель ее миссии – получить образцы паразита Лас-Плагас.