Шейхшах, бежавший в Гилян от шаха Исмаила, вернулся в Ширван в 908 г.х./1502 г. и занял трон ширваншахов, покинутый Султан Махмудом. Наместник сефевидов Шахгельди-ага, вынужден был оставить Ширван. Население Ширвана было довольно наступившим справедливым правлением Шейхшаха. Спустя некоторое время, в 911 г.х./1505/6 г. Султан Махмуд, живший при дворе шаха Исмаила, задумал сместить своего дядю и вновь воцарится в Ширване. Шах Исмаил предоставил ему отряд войск кызылбашей, с которым тот вскоре прибыл в Ширван, чтобы вернуть себе трон ширваншахов. Более трех месяцев он осаждал крепость вблиз Шемахи (вероятно, Бигурд), где укрылся Шейхшах со своими войсками. Положение Шейхшаха было тяжелым, однако случай избавил его от поражения и гибели. Любимый раб Султан Махмуда, мамлюк Карабек, когда его господин спал, перерезал ему горло и этой же ночью отослал его голову Шейхшаху. Обрадованный, Шейхшах приказал бить в барабаны и развернув знамена, не дожидая утра, выступил из крепости со своим войском. Захваченные врасплох кызылбаши бежали, но многие попали в плен и были уничтожены. По мнению Е. А. Пахомова, поход Султан Махмуда в Ширван с сефевидскими войсками, занявшими в это время Шемаху и Шабаран, согласно нумизматическим данным, относится к 911 г.х./1505/6 г. так как в это время в указанных городах монеты чеканилось от имени не Шейхшаха, а шаха Исмаила Сефеви. Е. А. Пахомов из этого сделал вывод, что во-первых, сефевидам, помогавшим Султан Махмуду, удалось занять не только Шемаху, но так же и Шабаран, а, во-вторых, что за эту помощь Султан Махмуд обязался признать себя подданным шаха Исмаила и чеканить монеты от его имени. Но источники сообщают об осаде Султан Махмудом крепости, где находился Шейхшах в продолжении трех месяцев, отсутствие же монет, чеканенных от имени Шейхшаха в течение почти двух лет, (911—912 гг.
х./1505/6—1506/7 гг.) дает возможность предположить, что Шейхшах после разгрома кызылбашей у крепости Гюлистан продолжал править в Ширване только после признания верховной власти шаха Исмаила и подчинения ему. Однако Шейхшах не оставил мысли о независимом управлении Ширваном. Воспользовавшись завоевательными походоми шаха Исмаила на османскую область Мараш для усмирения племени зуль-кадар в 913 г.х./1507/8 г., Шейхшах перестал выплачивать положенную дань Исмаилу и позволил себе непочтительно принять его представителей. С этого времени т. е. с 913 г.х./1507/8 г., Шейхшах вновь стал чеканить монеты от своего имени. Шах Исмаил в конце 915 г.х./1509 г. предпринял второй поход на Ширван, вызванный нежеланием Шейхшаха платить дань. Достигнув Куры, он перешел ее по наведенному понтонному мосту. Весть об этом распространилась по всему Ширвану. Шейхшах, услышав о прибытии шаха и учитывая состояние сил, укрылся в крепости Бигурд. Исмаил послал своих эмиров для занятия Шемахи, а сам с частью войск направился в Баку. Комендант крепости Баку явился в ставку шаха с подарками и, выразив покорность, передал ему ключи от города. Из Баку Исмаил последовал в Шабаран, управляющий этой области также поспешил встретить его и подчиниться, как и другие правители крепостей Ширвана, за что они были удостоены наград и почетной одежды. Шах поручил управление этими крепостями Леле-беку Шамлу. После этого Исмаил подошел к Дербенду. Эмиры Йар Ахмад Ага и Мухаммад-бек, надеясь на прочность дербендских укреплений, не вышли навстречу шаху и не послали подарков.
Шах Исмаил преступил к осаде Дербенда, кызылбаши сделали 12 подкопов под башнями крепости. Осажденные дербендцы сбрасывали на кызылбашей камни и стрелы. Увидев бесполезность сопротивления, Йар Ахмад Ага и Мухаммад-бек с саблями на шеях и саванами на плечах явились в ставку к Исмаилу и согласились сдаться. Правителем Дербенда шах назначил Мансур-бека. Исмаил приказал останки шейха Хейдара, пролежавшие в Табасаране в течение 22 лет, перенести в Ардебиль и похоронить в фамильной усыпальнице. Около месяца пробыл шах Исмаил в Южном Дагестане. В результате этого похода Шейшах окончательно стал вассалом Исмаила. Надписи из селений Шиназ и Гельхен рассказывают о «разрушении селений Курах и Кура Шейхшахом в 917 г.х/ 1511–1512 гг.». Курах и Кюре попали в зависимость от Ширвана и Ирана. Исходя из этого можно определённо установить, что часть владений Эмирства Ильчи Ахмада такой вассалитет признавали не сразу и добровольным оно не было. Управление над ними получили лояльные ширваншахские вассалы, тоже из потомков Ильчи Ахмада из крепости Ихир. Так Али-бек обратился к правителю Ширвана с просьбой дать ему в управление Курах и Кура (Кюре) и, получив такое разрешение, он отправился в Курах. Объединив Кюру и Курах в одно, подвластное Ширвану владение. Столицей нового политического образования становится Курах, куда Али-бек переносит свою резиденцию. Таким образом, в ХVI веке на политической карте Южного Дагестана возникло крупное полузависимое феодальное владение, которое включало в себя лезгинские села левобережья Самура, долины Курах-чая. Южной границей владения являлся самурский хребет на юге, водораздел Сулака и Самура на западе, владения Табасарана на севере и востоке. Подчинив себе опять Ширван, шах Исмаил перешел Куру и провел зиму в Карабахе, а весной вернулся в Тебриз для подготовки нового похода на Хорасан. Шейхшах после похода шаха на Ширван, видя его успехи и победы, решил с ним сблизиться и согласился платить дань. После победы шаха Исмаила над Шейбак-ханом в Хорасане в 916 г.х./1510/11 г. Шейхшах, наряду с другими правителями, отправил ко двору Исмаила посольство и принес ему свои поздравления. С тех пор дружеские отношения с шахом не прерывались. Милостивое отношение Исмаила к Шейхшаху проявилось вскоре после неудачи шаха в Чилдырианской битве в 920 г.х./1514 г. с турецким султаном Селимом. В 924 г.х./1518 г., когда тебризский двор торжественно отмечал рождение принца Сам-Мирзы, шах отправил в Ширван для переговоров с Шейхшахом эмиров Мирза-Шах Хусейна и Джамал ад Дина Мухаммада. Они заверили ширваншаха в милостивом отношении к нему шаха Исмаила и передали приглашение приехать к нему в Тебриз. В ответ Шейхшах послал с ними Исмаилу породистых коней, бардинских мулов, турецкие и европейские ткани, большое количество денег, драгоценных камней и обещал послать к сефевидскому двору своего сына, а если шах прикажет, то явиться лично. По сведениям Румлу, Шейхшах в 924 г.х./1518 г. прибыл ко двору шаха в Тебриз, наряду с другими правителями.
По-видимому, Шейхшах вторично прибыл к шаху в его летнюю ставку в Саханд близ Мараги, так как Мюнеджжим-баши пишет: он [Шейхшах] искал мира с шах Исмаилом, с котором он старался быть любезным и к которому он явился в 927 г.х./1521 году. Последний отнесся к нему с большой милостью и почетом и, дав ему новые грамотны на управление Ширваном, отослал его обратно в его владения. Согласно своему обещанию ширваншах послал в Тебриз ко двору Исмаила своего сына Султан Халила с ценными подарками и предложением закрепить узы дружбы путем его брака с дочерью шаха. Предложение было принято и Исмаил обручил свою дочь Перихан-ханум с сыном ширваншаха Султан Халилом. В 929 г.х./1523 г. шах Исмаил выразил желание жениться на дочери ширваншаха Шейхшаха. 25 зул-хиджа 929 г.х./5 ноября 1523 г. была пышно отпраздновала свадьба шаха Исмаила с дочерью ширваншаха вблиз Тебриза. По сведениям Мюнеджжим-баши, Шейхшах правил 22 года, проявляя справедливость и беспристрастие, и умер своей смертью в 930 г.х./1524 г.
Источники отзываются о нем, как о мудром и справедливом правителе, набожном и покровительствующим мусульманским ученым (улемам). Он оставил семь сыновей. Один из его сыновей Мухаммед Мирза позже прибыл ко двору Тахмаспа I и погиб в бою с узбеками у Зурабада в 935 г. х./1528/9 г. Другой сын Шейхшаха Музаффар Мирза ушел в страну Шамхала, своего родственника, и оставался там под его покровительством. Источники называют еще одного сына Шейхшаха Фаррух Йасара или Фаррух Мирзу или Султан Фарруха, как отца малолетнего Шахруха, который бежал в Дагестан к Шамхалу, своему родственнику, и оставался под его покровительством.
Махмуд из Хиналуга События в Дагестане и Ширване XIV—XV вв.
Амри Шихсаидов Дагестанские святыни. Книга третья
Мунеджимбаши Ахмед Деде «Джами ад-Дувэль».
Хасан-бек Румлу «Ахсат ат таварих».
Хуршах ибн Кубад ал-Хусейни «Тарих-и ильчи»
Монеты Ширваншахов династии Дербенди.