Дата основания Алатырского Киево-Николаевского 3-классного необщежительного женского монастыря точно не установлена. Монастырь первоначально назывался Покровский Ладинский-Подгорский Новодевичий монастырь. Впоследствии в его название вошло прилагательное — Киевский. Новодевичьим назван по причине существования в Алатыре другого Николаевского женского монастыря.
Как было сказано выше, точная дата основания неизвестна; однако впервые монастырь упоминается в 1603 году. У 1639 году — основан вновь игуменьей Ладинского Прилуцкого монастыря Елисаветой (Летинской) вместе с 52 монахинями, часть которых пришла из Киева, и их духовником игуменом Мефодием, «изгнанными ляхами».
В 1690 году церкви и постройки сгорели. Из соседнего Алатырского Троице-Сергиева монастыря (о нем мы уже рассказывали читателю в одной из предыдущих статей об Алатыре) была перенесена старая деревянная церковь во имя Живоначальной Троицы и построена на старом церковном месте теплая церковь во имя Вознесения Господня. Игуменья Елизавета на новом месте возвела церковь Св. Николая Чудотворца.
При Екатерине II многие монастыри были упразднены, в том числе и соседний Николаевский Стародевичий монастырь. Настоятельница и сестры перешли в Киево-Никольский монастырь.
Монастырь был закрыт в 1919 году. В 1993 году монастырь был возвращён Русской православной церкви. К 2000 году были восстановлены Вознесенский, Покровский храмы, вновь построена Никольская надвратная церковь.
