Министерство магии Великобритании было официально учреждено в 1707 году с назначением на должность первого министра — волшебника Улика Гампа (в реальном мире в этом году Англия и Шотландия объединились в одно государство — Великобританию, так что дата, вероятно, выбрана Роулинг не случайно). Министр магии избирается демократическим путём, но бывали кризисные времена, когда должность предлагали тому или иному волшебнику без соответствующего голосования (Альбусу Дамблдору делали такие предложения неоднократно, но он неизменно отказывался).
Определённого срока министерских полномочий нет, однако министр обязан регулярно, с интервалом максимум в семь лет, проводить очередные выборы. Министры магии занимали свои должности, как правило, дольше, чем маггловские министры. В целом, несмотря на ворчание и возмущение, сообщество волшебников поддерживает своего министра в большей степени, чем это можно увидеть в магловском мире. Возможно, это связано с подозрениями волшебников, что если они не смогут управлять своей жизнью сами, маглы непременно вмешаются.
Премьер-министр магглов не имеет никакого влияния на назначение нового министра магии, чьи выборы являются исключительно прерогативой волшебного сообщества. Все вопросы, связанные с жизнью магической Британии, являются прерогативой Министра магии, и Министерство находится исключительно в его юрисдикции. Экстренные визиты министра магии к премьер-министру объявляются портретом Улика Гампа (первый министр магии), висящим в кабинете премьер-министра маглов в доме 10 по Даунинг-стрит.
Ни один премьер-министр магглов никогда не входил в здание Министерства магии по причине, наиболее лаконично изложенной министром Дугалдом Макфэйлом (в должности 1858-1865): «Их крошечные мозги не справятся с этим».
Министр магии не подотчётен бюрократической системе обычного, «маггловского» правительства, хотя и контактирует с действующим премьер-министром (единственным из членов маггловского правительства; контактирует ли Министр магии с британским монархом, неизвестно).
Такие контакты практически односторонни: Министр магии представляется вновь избранному премьер-министру, ставит того в известность, что рядом с обычными обывателями живут обыватели необычные, но за их безопасность беспокоиться не следует, для этого есть Министерство магии.
В экстренных случаях, когда в мире магов происходит что-то достаточно опасное для маглов, Министр магии может сообщить об этом премьеру.