В 1479 году псковские мастера построили церковь Иоанна Златоуста в монастыре того же имени. В 1484—1485 годах они же воздвигли церковь Разположения у двора великого князя. В 1484 году вместо старого разобранного храма Благовещения закладывается новый каменный храм, законченный в 1489 году.
Сооружаются и гражданские здания. В 1483 году чудовский архимандрит разрушил старую и построил новую каменную трапезу. Великий князь тогда же заложил «казну» вблизи подклета храма Благовещения и кирпичную палату «с казнами». В 1485 году заложили «великий погреб на казенном дворе». Кирпичные палаты построили в том же году Василей Образец и Голова Володимиров сын.
Одним из наиболее выдающихся гражданских зданий XV века является Грановитая палата (название от граней на наружных стенах, называлась также Большой Золотой). Она построена в 1487—1491 годах для торжественных приёмов, свадеб, угощения посольств, происходивших в ней впоследствии многократно. В этих целях она имела особый ход и большие сени. Здание возобновлялось в 1547 году после пожара.
Высота Грановитой палаты — 8 саженей 1 аршин, длина вместе со Святыми сенями — 17 1/2 сажени, ширина — 10 саженей 2 аршина. Толщина стен палаты — 2 1/4 аршина. Святые сени (название от икон, которыми они расписаны) длиной 11 саженей 1 аршин, шириной 4 1/2 сажени.
В палату вело Красное крыльцо длиной в 12 саженей 1 аршин, высотой до верхней террасы в 9 саженей 8 вершков. Оно имело 43 ступени при трёх маршах. Все большое помещение палаты (24 м X 23 м) перекрыто четырьмя крестовыми сводами, которые опираются на стены и квадратный опорный столб посреди палаты. Расписывал её «изограф» Симон Ушаков.
Соответственно своему государственному назначению Грановитая палата, её двери, окна богато разукрашены изящной резьбой, орнаментами.
Как пишет очевидец, «в каменом дворце, Золотой палате печь устроена под землею с душниками для нагревания комнат» (калориферное отопление).
В 1532 году под Москвой в селе Коломенском построена первая каменная шатровая церковь Вознесения. В плане она имеет крестообразную форму, которая затем переходит в световой восьмигранник. Последний завершается кирпичным шатром, суживающимся кверху. Вот как оценивает это сооружение И. Грабарь: «Смелая мысль — поставить на крещатый низ обширный восьмерик — могла возникнуть лишь при взгляде на торжественный строительный приём, исполненный из дерева, где он так прост и лёгок... Исполнить такую затею в кирпиче и камне трудно, и нужно удивляться, как решительно и смело зодчий Коломенского храма справился с ней».
Храм, имея высоту в 58 м, превышает ряд известных западноевропейских соборов, в том числе и Собор Парижской Богоматери (35 м) и не намного ниже его башни (69 м).
Непревзойденным апофеозом русского строительного искусства XVI веке является Покровский собор на рву (храм Василия Блаженного). Он сооружён Иваном Грозным в 1554—1560 годах в память покорения Казанского и Астраханского царств и является ярким выражением торжества и славы могущественного Русского государства.
Как указывает летописец: «поставлен бысть храм каменный преудивлен, различными образцы и многие переводы, на одном основании девять престолов». Здесь сжато изложены все особенности сооружения. На общем основании, подклете, построено девять церквей, при чем все они различны по архитектурному оформлению. В целом же создан «преудивительный храм».
Основание его представляет один сплошной монолит с небольшими пустотами; при нём находится церковь Василия Блаженного с приделом Рождества Богородицы, колокольня с девятью колоколами и лестница. Кроме папертей я печи для отопления остальные помещения представляют подвалы. Характерны для сооружения толстые стены, лестница в стене, большое количество закоулков, в которых легко было сделать склады, тайники для различных целей, В общем основание церкви представляло надежное предмостное фортификационное сооружение.
Верхний этаж, кроме самого Покровского собора, включает еще восемь различных церквей, расположенных вокруг него. Кругом имеются ходы, галереи, площадки и паперти.
Храмы построены в виде столпов глубокого национального и самобытного стиля. Главный престол Покрова Богородицы имеет высоту от пола до купола 47 меров и заканчивается шатровым верхом. Остальные главы разнообразны по своим формам, отделке и украшениям. Но всё в целом поражает гармонией отдельных деталей с общим архитектурным замыслом, соразмерностью пропорций, богатством неистощимой творческой фантазии, величественностью и красотой.
Всё лучшее, своеобразное, что веками вырастало из глубин русского духа и выливалось в строительстве в виде узорчатых деревянных палат и домов, высоких шатров, многогранных церковных столпов, кокошников, узорчатой росписи, — всё это запечатлено в камне и кирпиче в храме Василия Блаженного.
Строили его русские мастера Барма и Посник с товарищами. Второй, Посник Яковлев, был умелый церковный мастер и горододелец, который сооружал также каменные стены в покоренной Казани. Но кроме этих двух мастеров, которые «быша примудрии и удобни таковому чюдному делу», в нём принимали участие многие другие русские люди. В храме этом применены железо-кирпичные конструкции — прообраз железобетона. О методе производства строительных работ можно судить по построению г. Стародуба в 1536 году. Замечательной особенностью московского зодчества являются его исключительные для того времени темпы: ведь соборы в Западной Европе, как указывалось ранее, строились десятки и даже сотни лет.
При Иване IV среди других сооружений надстроены четыре придела над папертями Благовещенского собора (1563—1564 годы). Он был заложен в 1397 году, расписан известным русским иконописцем Андреем Рублевым в 1405 году. Перестроен в 1484—1489 годы вновь о девяти верхах с позолоченными главами и кровлей. В 1565 году выстроено прекрасное здание Посольского приказа вблизи колокольни Ивана Великого.
«Столп» (колокольня) Ивана Великого, надстроенный царём Борисом в 1600 году, представляет выдающееся по своей высоте сооружение. Его вершина (с крестом) составляет 38 1/2 сажени (82 метра), а над уровнем реки Москвы—57 саженей 1 аршин 5 3/4 вершка (122, 6 м).
Господствуя над всей Москвой, "Иван Великий" является военным наблюдательным пунктом, колокольней кремлевских соборов, благовест которой широко разносился по столице. Колокольня включает в себе небольшую церковь Иоанна Лествичника, «что под колоколы». Рядом находится звонница, сооруженная Петром Малым в 1532—1543 годы, и «Филаретовская пристройка» — в 1624 году.
Эта центральная в Кремле группа сооружений является как бы символом древней Москвы, рвущейся ввысь и вместе с тем крепко связанной с родной русской землёй.
Иван Великий вызывал изумление у иностранцев. О колокольне Ивана Великого Самуил Маскевич писал: «Церковь св. Иоанна замечательна по высокой каменной колокольне, с коей далеко видно во все стороны столицы. На ней двадцать два больших колокола, в числе их многие не уступают величиною нашему Краковскому Сигизмунду; висят в три ряда одни над другими, меньших же колоколов более тридцати. Непонятно, как сия башня может держать на себе такую тяжесть... Чтоб размахнуть иной язык (колокола) требуется человек восемь и десять».
А. Олеарий говорит: «Посреди Кремлёвской площади стоит высочайшая колокольня — «Иван Великий», которая обита позолоченной жестью и полна колоколов. Рядом с ней стоит другая колокольня, на которой висит очень большой колокол».
В 1759 году было повелело исправить происшедшие повреждения главы Ивановской колокольни в Кремле. В связи с этим была сделана опись ветхостей колокольни и составлены архитектором Д. Ухтомским драгоценнейшие чертежи этого сооружения.
Башня в плане восьмиугольная. Расстояние между наружными противоположными стенами — 7 саженей, толщина их — около 2 1/2 саженей.
В самом низу находилась церковь Иоанна Лествичника с алтарём, трапеза и лестница в стене во второй этаж. На нём восьмиугольная площадка, «осмерик», где «во время викториальных дней для фонтанов вместо бакинов поставляемы бывают чаны», и проходы к окнам. Толщина стен — 2 сажени 8 вершков.
В третьем этаже кроме центрального «осмерика» имеются прохода и площадки по всему периметру стен башни. Появляется винтовая каменная лестница.
Строение рядом с колокольней представляет церковь Рождества Христова, находящуюся во втором этаже с лестницей. Обращают на себя внимание массивные стены палаты под церковью. Лестница вокруг каменного столба ведет в Звонарскую палату.
Лестница ведёт к Великопостному колоколу, который висел над площадкой.
В нижнем ярусе колокольни висело 6 колоколов весом по 450 — 200 пудов; во втором (среднем) ярусе—13 колоколов по 200—40 пудов; в третьем ярусе—10 колоколов по 50—8 пудов.