ТАСС, 24 октября. Индийские молекулярные биологи адаптировали геномный редактор CRISPR/Cas12 для создания экспресс-теста на вирус оспы обезьян, который позволяет выявить инфекцию с почти 100% точностью за несколько десятков минут после сбора биоматериала. Первые опыты с этой системой описаны в электронной библиотеке medRxiv.
После начала пандемии COVID-19 ученые начали разрабатывать подходы, позволяющие быстро, точно и при этом дешево выявлять следы конкретных вирусов в биожидкостях пациентов и в природных и городских средах. В частности, год назад биологи из США приспособили геномный редактор CRISPR/Cas12 для поиска следов различных штаммов коронавируса в образцах слюны пациентов.
Их индийские коллеги под руководством Девашиша Рата, руководителя группы в Центре атомных исследований имени Хоми Баба в Тромбее (Индия), использовали эту вариацию "нобелевского" редактора ДНК для создания экспресс-теста на следы присутствия в биообразцах частиц вируса MPXV, вызывающего вирусную оспу обезьян.
Экспресс-тест на вирус
Для разработки этой системы тестирования исследователи изучили и сравнили между собой структуру polA, ключевого гена вирусов оспы, который отвечает за подготовку новых копий ДНК этих патогенов. В результате этого исследователям удалось выделить небольшой участок в этом гене, уникальный для MPXV и обладающий иной структурой в геноме остальных представителей рода Orthopoxvirus.
После этого исследователи модифицировали РНК и белковые компоненты геномного редактора CRISPR/Cas12 таким образом, что они начали соединяться с этим участком гена polA и вырабатывать светящиеся молекулы. Работу этой системы биологи проверили на растворах, содержавших смесь из частиц MPXV, а также нескольких других вирусов оспы.
Эти опыты показали, что модифицированная версия CRISPR/Cas12 очень быстро фиксировала следы вируса в образцах даже в тех случаях, когда в них содержалось несколько десятков полных копий или обрывков генома MPXV. Это также происходило и при добавлении в раствор частиц вирусов оспы птиц и других представителей рода Orthopoxvirus, что делает данную систему особенно перспективной для выявления носителей вирусной оспы обезьян в регионах, где распространяются несколько разновидностей этих патогенов.
Следует добавить, что статья, о которой рассказывается в этой новости, представляет собой так называемый препринт. Это означает, что ее не рецензировали независимые эксперты и не проверяли редакторы научных журналов, как это обычно бывает в подобных случаях. Поэтому к выводам из нее и аналогичных статей нужно относиться осторожно.