Помимо больницы св. Николая Чудотворца (310 штатных мест) в 1884 году места для душевнобольных у города были только в Градских богадельнях (50 мест) и в больницах на Большой и Малой Охте (380 мест) — всего 850 мест. Количество мест было явно недостаточным для стремительно растущего Санкт-Петербурга. Уже в 1885 году в зданиях переданной городу Министерством внутренних дел загородной больницы в Удельной была открыта больница св. Пантелеймона на 520 мест, старший врач которой находился в подчинении главного врача больницы св. Николая Чудотворца.
К 1896 в больнице находится 670 больных при штатной коечной мощности 380 мест
В 1896 году было принято решение об увеличении коечной мощности за счет вывода из здания больницы квартир сотрудников.
Коечная мощность увеличивается до 580 коек, однако уже к 31.08.1897г. по свидетельству французского психиатра Шарля Валлона больница вновь была переполнена, на тот момент в ней содержался 781 пациент, а санитарное состояние оставляло желать лучшего.