Владимир Прохорович Амалицкий родился в 1860 году в деревне Старики, которая находилась на границе России и Австрийской империи. В 1879 году Амалицкий стал студентом естественного отделения физико-математического факультета Императорского Санкт-Петербургского университета.
Любимыми его предметами в университете были минералогия и геология. Когда Владимир Амалицкий увлекся этими науками, сейчас сказать уже сложно, воспоминания об этом не остались. Эти предметы ему преподавали: Василий Васильевич Докучаев и Александр Александрович Иностранцев.
В 1883 году Владимир Прохорович защитил кандидатскую диссертацию и в том же году получил приглашение от Докучаева принять участие в оценке земель Нижегородской губернии. Амалицкий согласился и все лето провел в губернии за работой. Помимо сбора материала для подготовки отчета по оценки земли, Амалицкому попадались и интересные находки, которые принадлежали двустворчатым моллюскам пермского периода. В 1884 году Владимир Прохорович вновь поехал в Нижегородскую губернию, но в этот раз изучать пермские отложения.
Остатки древних двустворчатых моллюсков в то время находили по всей планете. Амалицкому нравилось их изучать, он ездил в Европу, сравнивал найденные раковины в России с образцами из других стран. Он описал десятки новых видов, уделял внимание их родственным связям, особенно, схожести пермских моллюсков из России и Африки. В 1895 году в Лондонском геологическом обществе Амалицкий выступил с докладом о том, что Россия и Африка в прошлом были связаны между собой через Индию единым материком. Данное утверждение расходилось с общепринятыми мнениями о пермском периоде и вызвало много возражений среди ученных.
Для более весомого доказательства своей гипотезы Амалицкий хотел найти хорошо сохранившихся скелеты крупных животных. И искать он собирался на севере России.
Летом 1895 года Амалицкий отправился на поиски, но первая поездка не принесла нужного результата, были найдены раковины, остатки растений и несколько позвонков и обломков черепа синапсида, похожего на дицинодонта. В 1896 году он отправился повторно на север России, были найдены остатки древних обитателей морской фауны, отпечатки, похожие на листья индийских глоссоптерисов, кости ящеров. Но все находки были в плохой сохранности и Амалийкий решил на время воздержаться от своей гипотезы о связи Африки, Индии и России.
Найденные кости ящеров не давали Амалицкому покоя, ведь среди них был череп похожий на парейазавра, который обитал на территории современной Африки. Съездив еще пару раз с женой на север, он решил уже организовать более масштабные раскопки с наймом рабочих. Для раскопок были выбраны два местонахождения: возле Опок и в линзе Соколки. Именно в Соколках Амалицкому повезло, была найдена конкренция длиной пять метров, по которой угадывался полный скелет ящера. Раскопки продолжались и по итогу добытые окаменелости заняли 64 ящика. Все это было отправлено в Варшаву, где Владимир Прохорович работал и жил в то время. На следующий год Амалицкий вернулся в Соколки и увеличил площадь раскопок. Всего за эти два года было найдено 27 скелетов и множество отдельных черепов, позвонков и других костей.
В конце 1900 года Амалицкий презентовал первый собранный скелет, это был парейазавр. Позже данному виду Владимир Прохорович даст название в честь геолога А.П. Карпинского - Pareiosaurus karpinskii. А найденные хищные ящеры получат название в честь Александра Александровича Иностранцева - Inostrancevia alexandri.
За пять лет раскопок коллекция из Соколков стала одной из самых богатейших во всем мире. Со временем скелеты стали переезжать в Петербург в Геологический музей.
В 1912 году коллекция Амалицкого была внесена в список важных ценностей и подлежала эвакуации в первую очередь в случае нашествия врага. После начало первой мировой войны так и случилось, Амалицкий получил приказ эвакуировать палеонтологическую коллекцию в Москву, но удалось перевезти не всё. Сам Амалицкий в 1916 году переехал в Кисловодск для лечения здоровья, но уже в 1917 в возрасте 57 лет скончался.
По итогу, коллекция Амалицкого была разделена на шесть частей. Самая ценная - в Петрограде, в геологическом музее, вторая часть в Нижнем Новгороде, где Владимир Прохорович успел поработать в институте. Третья часть находилась на раскопках на севере России. Четвертая часть оставалась в Варшаве, пятая - в Москве, а шестая - в Кисловодске. Собрать все вместе решила жена Амалицкого - Анна Петровна. Несмотря на сложности в стране (гражданская война), коллекция все же была собрана в одном месте - В Петрограде. А позже палеонтолог Александра Паулиновна Гартман-Вейнберг вовсе выделила найденных Амалицким парейазавров в новый отдельный род - скутозавры.
В 1934 году Палеозоологический музей и институт, которые отсоединилась от геологического музея, переехали В Москву. Но само помещение под палеонтологический музей было выдано только в 1936 году, недалеко от Парка культуры и отдыха имени Горького. Популярность музея росла, посетителей было все больше и больше, теперь в нем можно было взглянуть не только на Северо-Двинскую галерею Амалицкого, но и на множество других ископаемых, особенно на больших динозавров из Монголии. В 1948 году в музей доставили последние конкреции Амалицкого (несколько десятков тонн). Помимо этого, палеонтологи постоянно привозили что-то новое из экспедиций. Места в музее стало катастрофически не хватать и в 1954 году музей закрылся из-за тесноты.
Коллекция Амалицкого и все другие палеонтологические ископаемые находились в подвешенном состоянии до 1987 года, когда случилось открытие нового палеонтологического музея на окраине Москвы, на территории академического санатория "Узкое". Музей получился очень большим - шесть залов, в одном из них (зал позднего палеозоя – начало мезозоя) и расположилась галерея позднепермских ящеров из Северо-Двинской галереи Амалицкого.
Когда приходишь в Палеонтологический музей им. Ю. А. Орлова, то скелеты из Соколков не кажутся чем-то уникальным, они уже стали одними из немногих в этом музее. Но по сей день коллекция Амалицкого и его раскопки остаются самыми крупными в России.