Мишутинский сельский Совет рабочих, крестьянских и красноармейских депутатов образован в 1924 году (Постановление Президиума ВЦИК от 11.02.1924 г.).
С 1924 по 1930 годы в административная единица Вожегодского района Вологодского округа Северного края.
С 1930 по 1937 годы административная единица Вожегодского района Северного края (Постановление Президиума ВЦИК от 23.07.1930 г.).
С 1937 года – Вожегодского района Вологодской области (Постановление ЦИК СССР от 23.09.1937 г.).
На основании Конституции СССР 1937 года фондодержатель был переименован – Исполнительный комитет депутатов трудящихся.
На основании решения Вологодского облисполкома от 11.02.1960 г. № 97 произошло объединение Мишутинского сельсовета с Лукьяновским сельсоветом в один – Лукьяновский сельсовет с центром в деревне Лукьяновская.
На основании решения Вологодского облисполкома от 12.11.1970 ьг. № 641 происходит разукрупнение на два сельсовета:
- Лукьяновский с центром в д. Лукьяновская;
- Мишутинский с центром в д. Чеченинская.
На основании решения Вологодского облисполкома от 12.07.1976 г. № 411 Лукьяновский сельсовет ликвидировался и вошел в состав Мишутинского сельсовета, и ста называться Мишутинским сельсоветом с центром в д. Мишутинская. Документы постоянного хранения и личного состава Лукьяновского сельсовета переданы Мишутинскому сельсовету, но акт передачи не составлялся.
С 7 октября 1977 года на основании Конституции СССР 1977 года фондообразователь переименован в исполнительный комитет Мишутинского сельского Совета народных депутатов Вожегодского района.
В состав Мишутинского сельсовета вошли 24 населенных пункта: Агафоновская, Алферьевская, Глазуновская, Горка, Доровиха, Дубровинская, Есинская, Ивановская, Ивонинская, Климовская, Лощинская, Лукьяновская, Матвеевская, Мишутинская, Некрасовская, пос. Озерный, Ожигинская, Патракеевская, Погорелка, Поповка, Тимонинская, Фатьяново, Чеченинская.
На бюджете сельсовета состояли следующие учреждения и организации: Лукьяновский и Мишутинский дома культуры, две начальных школы, три медпункта.
Исполнительный комитет являлся исполнительным и распорядительным органом сельского Совета народных депутатов. Избирался из числа депутатов на первой сессии нового созыва в составе председателя, его заместителя, секретаря и 4-х членов Совета.исполком осуществлял повседневное руководство хозяйственным и культурным строительством на своей территории, руководил деятельностью колхоза «Организатор» и подчиненных ему организаций и предприятий, органихзовывал непосредственное обслуживание культурных и бытовых потребностей населения, контролировал правильное исполнение бюджета, обеспечивал общественный порядок на подведомственной территории, следил за быстрым и точным исполнением заказов, указаний и постановлений правительства и вышестоящих органов государственной власти.
На основании Закона Вологодской области от 06.12.2004 года № 1111 – ОЗ
и свидетельства о государственной регистрации Устава муниципального образования от 05.12.2005 года, с 01.01.2006 года муниципальному образованию установлен статус поселения.
Предшественником сельского поселения Мишутинское являлась администрация Мишутинского сельсовета, которая ликвидирована на основании постановления главы Вожегодского муниципального района от 21.10.2005 года № 261 «О ликвидации администраций поселка Вожега и сельсоветов Вожегодского муниципального района». Сельское поселение Мишутинское являлось правопреемником исполнительного Комитета Мишутинского сельсовета народных депутатов и администрации Мишутинского сельсовета.
Структуру органов местного самоуправления составляли представительный орган поселения - Совет сельского поселения Мишутинское, Глава сельского поселения Мишутинское, исполнительно – распорядительный орган – администрация сельского поселения Мишутинское, обладавшие собственными полномочиями по решению вопросов местного значения.
Совет поселения и администрация поселения в соответствии с федеральным законодательством обладали правами юридического лица.
Совет поселения состоял из 8 депутатов, избираемых населением поселения на муниципальных выборах на основе всеобщего равного и прямого избирательного права при тайном голосовании сроком на 4 года.
Администрация поселения орган, наделенный в соответствии с у ставом полномочиями по решению вопросов местного значения поселения и полномочиями для осуществления отдельных государственных полномочий, переданных органам местного самоуправления поселения федеральными законами и законами вологодской области.
Глава поселения избирался гражданами, проживающими на территории поселения и обладающими избирательным правом на основании всеобщего и прямого избирательного права при тайном голосовании сроком на 4 года.
Глава поселения возглавлял местную администрацию и исполнял полномочия председателя Совета поселения.
Территорию сельского поселения Мишутинское составляли 24 населенных пункта с центром д. Мишутинская.
Расстояние до райцентра 66 км.
На балансе администрации поселения находились Мишутинский СДК, Исаковский СДК, два филиала ЦБС, котельная, здание администрации поселения.
С 1 июня 2022 года Законом Вологодской области от 6 мая 2022 года № 5125-ОЗ «О преобразовании поселений, входящих в состав Вожегодского муниципального района Вологодской области, путем их объединения, наделении вновь образованного муниципального образования статусом муниципального округа и установлении границ Вожегодского муниципального округа Вологодской области» сельское поселение Мишутинское утратило статус муниципального образования. Органы местного самоуправления сельского поселения продолжали свою деятельность в течение переходного периода до 1 января 2023 года.
С 1 января 2023 года сельское поселение Мишутинское как публично-правовое образование, органы местного самоуправления сельского поселения Мишутинское были ликвидированы. Имущество, составлявшее казну сельского поселения Мишутинское, перешло в собственность вновь образованного муниципального образования - Вожегодского муниципального округа. В д. Мишутинская был создан Мишутинский территориальный отдел Вожегодского муниципального округа.
Вожегодский муниципальный округ Вологодской области находится в административных границах рабочего поселка Вожега, Бекетовского, Липино-Каликинского, Пунемского, Вожегодского, Кадниковского, Мишутинского, Нижнеслободского, Огибаловского, Тавенгского, Тигинского, Митюковского, Ючкинского, Марьинского, Раменского, Явенгского сельсоветов Вожегодского района.